福建柏垂直分布于海拔580-1500米，但在1000-1300米的常綠闊葉林中較常見。陽性樹種，適生于酸性或強(qiáng)酸性黃壤、紅黃壤和紫色土，花期3月中旬至4月，第二年10月球果成熟。
福建柏多散生于中亞熱帶至南亞熱帶的針闊混交林中，在個(gè)別地方偶有小片純林。為淺根性陽性樹種，主根不明顯，側(cè)根發(fā)達(dá)。幼年能耐一定的庇蔭，在林冠下能天然更新，長成小樹后，需光量逐漸增加。在生境、水肥充足、土層深厚、排水良好的立地條件，生長迅速，在年平均氣溫11.5-16.5℃的溫暖、溫和、溫涼地區(qū)均有分布，喜生于雨量充沛、空氣濕潤的地方。對低溫具有一定的耐寒能力，低溫不超過-12℃。正常結(jié)實(shí)在20年前后。造林地宜選山坡中部以下緩坡及山洼等土層較厚的地方

現(xiàn)狀：稀有種，因過度采伐，天然林面積日益縮小，現(xiàn)散生數(shù)量不多，更新能力弱。
措施：建議在本種分布較集中的湖南都龐嶺等地建立自然保護(hù)區(qū)。其余地區(qū)應(yīng)保護(hù)好現(xiàn) 存母樹，開展采種育苗，大大營造人工林。福建安溪半林林場已種有較大面積的福建柏人工林。 福建柏種群數(shù)量逐漸，生境受到的破壞又較嚴(yán)重，因此，對福建柏應(yīng)加強(qiáng)保護(hù)。在集中分布的習(xí)水縣良村三岔望仙臺和天堂溝，應(yīng)建立福建柏自然保護(hù)區(qū)，對以福建柏為優(yōu)勢的群落，應(yīng)劃為相應(yīng)的保護(hù)地段，嚴(yán)禁砍伐破壞。對于個(gè)別大樹，應(yīng)作為采種母樹加以保護(hù)。

福建柏屬植物約起源于晚侏羅紀(jì),起源中心在東亞環(huán)太平洋地區(qū),第四紀(jì)冰期后僅福建柏1種殘存中國南方和越南北方,形成殘遺中心。據(jù)史料分析,福建柏歷史上分布較現(xiàn)代廣泛,自中國東部福建沿海至云貴高原東南部沿南嶺山脈緯度一線基本呈連續(xù)分布。現(xiàn)代中心分布區(qū)在東經(jīng)110°～119°,北緯24°30′～26°30′,呈間斷分布;垂直分布海拔500～1800m,往西、往北分布海拔較高,往東、往南分布海拔較低;分布區(qū)屬中亞熱帶濕潤氣候。福建柏為淺根性樹種,樹冠承雪量大,易遭大風(fēng)和冰凍危害,成為其向高海拔地區(qū)發(fā)展的限制因素。