聚脲防水涂料和聚氨酯防水涂料之間的區別主要在于它們的化學結構、固化過程、性能特點以及應用領域。
化學結構上的差異：聚氨酯是由含端異氰酸酯化合物與含多羥基化合物反應形成，含有氨酯鍵和其他化學鍵。而聚脲是由含端多異氰酸酯與端多元胺反應形成，含有脲鍵和其他化學鍵。
固化過程的不同：聚氨酯的固化過程需要一定的溫度和催化劑，而聚脲的固化過程無需催化劑，也不需加熱即可迅速反應。聚脲的這一特性使得它在施工時能夠快速固化，提高施工效率。
性能特點上的差異：聚脲固化后的橡膠膜中脲鍵的數量超過氨酯鍵數量，因此其性能主要由脲鍵所決定，表現為更高的強度和穩定性。脲鍵強度大大超過氨酯鍵強度，并且脲鍵很穩定。此外，聚脲具有更加的防水、防鹽堿腐蝕、高耐磨、耐劃傷、高延展等性能。
應用領域的區別：聚氨酯防水涂料因其良好的彈性和延伸率，在建筑防水行業得到廣泛應用。而聚脲防水涂料由于其出色的性能，如防水、防腐、附著力強、耐磨、耐高溫等，近年來發展迅速，尤其適用于需要高強度、高耐候性防水材料的領域。

聚脲涂料柔韌有余、剛性十足、色彩豐富，它致密、連續、無接縫，完全隔絕空氣中和地面上的水分和氧氣的滲入。反應活性高、固化速度快：垂直面、頂面及任意曲面可連續噴涂，不流掛。聚脲彈性體不需催化劑。對溫度、濕度不敏感：施工時受環境溫度、濕度影響小。聚脲還具有耐磨、抗沖擊、抗疲勞、耐老化、耐高溫、耐核輻射等多種功能。

聚脲防水涂料的拉伸強度高、使用壽命長，能夠形成連續嚴密、整體、無任何搭接的一體防水涂層，能夠有效阻絕竄水，起到十分的防水效果。