明清以來，隨著栽培面積的增加，育種品種數量大幅度增加，品種文獻也大量出現。如《雜黃本草》、《小巷漫步者》、《學府札記》、《本草綱目》、《地方志》等都記載了柿子品種的名稱。據不完全統計，柿子品種有牛心柿子、蒸柿子、蓋柿子、塔石、滿紅、黃石、竹石、柿子、火鍋柿子、方子、四棱柿子、六棱柿子、干肉柿子、霍竹柿子、青柿子、海門柿子等74多個品種，柿子罐頭、無籽柿子、吉心柿子、鴨肉柿子、鹿心柿子、四縫柿子、鏡面柿子、竹節柿子、楊國紅、火關柿子、柿子、花蓋柿子、牛奶柿子、銅盤柿子、漆皮柿子、胡柿子、漢柿子、大石柿子、寶蓋柿子、方地柿子、山石柿子，朱紅石、汴化柿子、方鼎柿子、沐柿、油石、昌鄉柿子、畬柿子、邊柿子、中石、日柿子、年竹柿子、田林柿子、蟾蜍柿子、蓮子柿子、小柿子、紅竹柿子、柿子、坡玉柿子、一點紅、崇帝、柔子柿子、刁柿子、豆子紅，紅柿子、珍珠柿子、梅花柿子、優厚角柿子、干柿子、糖柿子、水師柿子、橘子柿子、紅棗柿子、崇泰柿子、木瓜柿子、青皮柿子、松陽柿子。
根據不同地區資源調查的不完全統計，我國共有963個品種。在果實大小、形狀、色澤、甜度、風味、難脫澀、高產、抗病性等方面存在一定差異。但是，由于各地的命名方法不同，出現了許多同名或異名的現象。
在中國以外，以日本為代表的柿子品種也在水果種植面積擴大后出現。延西時期（公元901-921年），柿子雖被視為果實中的珍品，但規模較小，但品種不多。直到1214年，在神奈川發現“望禪寺”（即“禪寺丸”）之后，品種名稱才相繼出現。1645年（正寶二年），松江崇萊在《茅草》中出現了柿子品種的名稱，如商城的碧柿子、錯的木蓮、香克的澀柿、榆樹的元氏、宣武的木蓮、玉鎖的柿子、沂石川后谷的川石柿子，八五溝柿、木蓮、新農川市、丹波碧柿子、安云西條柿子等。

花器的形成與演化
柿樹的花由短縮枝演化為完全花，再分化為雌花型和雄花型。
從某些品種的返祖現象可以推斷出這一規律。無論是托葉、萼片、花柄、雄蕊、雌蕊等部分的花器官，都可以從葉痕的變化中找到。例如，元宵柿子的托葉很大，有的和枝干的葉子一樣大；蜜罐的花莖部分或全部變成綠色萼片，有的雄蕊變成花蕾，有的甚至是綠色的；南漳竹頭柿子成熟表面偶爾出現綠色縱紋。這些都在不同程度上反映了葉片的特征，可以推斷，花是由短枝演化而來的。[2]
柿子的花序是由三朵小花組成的小聚傘花序。在雌花的花芽分化過程中，兩側小花停止分化（有的品種偶有側花發育完全），托葉腋生葉常見干痕，中間小花分化正常，形成大的腋生單花；在雄花型中，中心花和兩側花正常，花芽分化完成，腋生花序保持。在雌花中，雄蕊有不同程度的退化，有的只有花絲，有的仍有空的花藥或花粉，偶爾也能發現一些正常的花粉，可分為雌花和完全雌花兩種類型；雄花雌蕊也有不同程度的退化，有的已經消失，有的只有子房的雛形，有的有子房卻沒有花柱，有的還有花柱沒有柱頭，還有完整的雌蕊沒有退化，所以可以分為雄花型和雄花型完全花。

原始柿果單寧細胞大而多，可溶性單寧也多，酒精脫氫酶少，因此可溶性單寧轉變為不溶性單寧的速度慢，成熟時澀味很濃。在長期栽培過程中，出現了種種變異，有的單寧細胞變小，單寧含量變少，酒精脫氫酶增加，于是可溶性單寧轉化為不溶單寧的速度快，當果實成熟時，可溶性單寧已少到使人不感到有澀味的程度，這樣就成了完全甜柿。 [2]
完全澀柿中一部分品種在種子開始成熟時產生某種物質能使單寧細胞中單寧收縮變褐，變褐了的單寧細胞圍繞種子周圍，無種子一方的果肉中單寧細胞中的單寧呈可溶性狀態，依然黃色，這種品種為不完全甜柿。種子產生的能使單寧收縮變褐的物質能力不強的則為不完全澀柿。