福建柏垂直分布于海拔580-1500米，但在1000-1300米的常綠闊葉林中較常見。陽性樹種，適生于酸性或強酸性黃壤、紅黃壤和紫色土，花期3月中旬至4月，第二年10月球果成熟。
福建柏多散生于中亞熱帶至南亞熱帶的針闊混交林中，在個別地方偶有小片純林。為淺根性陽性樹種，主根不明顯，側根發達。幼年能耐一定的庇蔭，在林冠下能天然更新，長成小樹后，需光量逐漸增加。在生境、水肥充足、土層深厚、排水良好的立地條件，生長迅速，在年平均氣溫11.5-16.5℃的溫暖、溫和、溫涼地區均有分布，喜生于雨量充沛、空氣濕潤的地方。對低溫具有一定的耐寒能力，低溫不超過-12℃。正常結實在20年前后。造林地宜選山坡中部以下緩坡及山洼等土層較厚的地方

現狀：稀有種，因過度采伐，天然林面積日益縮小，現散生數量不多，更新能力弱。
措施：建議在本種分布較集中的湖南都龐嶺等地建立自然保護區。其余地區應保護好現 存母樹，開展采種育苗，大大營造人工林。福建安溪半林林場已種有較大面積的福建柏人工林。 福建柏種群數量逐漸，生境受到的破壞又較嚴重，因此，對福建柏應加強保護。在集中分布的習水縣良村三岔望仙臺和天堂溝，應建立福建柏自然保護區，對以福建柏為優勢的群落，應劃為相應的保護地段，嚴禁砍伐破壞。對于個別大樹，應作為采種母樹加以保護。

福建柏為中國特有的單種屬植物，在研究柏科植物系統發育方面有科學意義。 樹形優美，樹干通直，適應性強，生長較快，材質優良，是中國國南方一些省（區）的重要用材樹種，又是庭園綠化的優良樹種。
福建柏有較強的抗風能力。可以用作保持水土，抗擊臺風的有效樹種。

福建柏木材輕，收縮度小，強度中等，質地略軟，紋理勻直，結構細，加工容易，切面光滑，油漆性欠佳，膠粘性良好，握釘力中等，易干燥，干后材質穩定，耐久性良好，是建筑、家具、細木工、雕刻的良好用材。可選作亞熱帶低山至中山的造林樹種。
樹根、樹樁可蒸餾揮發油，為制造香皂之香料。

福建柏形態特征 常綠喬木，枝、葉似羅漢柏，鱗葉質地較薄，在枝上明顯成節，中央之葉露出部分楔形，較兩側者為窄或近等寬。樹高達20米。有鱗葉小枝扁平，上面綠色，下面有白粉，葉交互對生。雌雄同株，球花單生枝頂。球果球形。種子卵形，具大小不等的薄翅。多散生于常綠闊葉林中，偶有小片純林。

福建柏屬植物約起源于晚侏羅紀,起源中心在東亞環太平洋地區,第四紀冰期后僅福建柏1種殘存中國南方和越南北方,形成殘遺中心。據史料分析,福建柏歷史上分布較現代廣泛,自中國東部福建沿海至云貴高原東南部沿南嶺山脈緯度一線基本呈連續分布。現代中心分布區在東經110°～119°,北緯24°30′～26°30′,呈間斷分布;垂直分布海拔500～1800m,往西、往北分布海拔較高,往東、往南分布海拔較低;分布區屬中亞熱帶濕潤氣候。福建柏為淺根性樹種,樹冠承雪量大,易遭大風和冰凍危害,成為其向高海拔地區發展的限制因素。