喬木，高達20米，蓬徑達3.5米；樹皮深灰色，縱裂，成條片開裂；幼樹的枝條通常斜上伸展，形成尖塔形樹冠，老則下部大枝平展，形成廣圓形的樹冠；樹皮灰褐色，縱裂，裂成不規則的薄片脫落；小枝通常直或稍成弧狀彎曲，生鱗葉的小枝近圓柱形或近四棱形，徑1-1.2毫米。葉二型，即刺葉及鱗葉；刺葉生于幼樹之上，老齡樹則全為鱗葉，壯齡樹兼有刺葉與鱗葉；生于一年生小枝的一回分枝的鱗葉三葉輪生，直伸而緊密，近披針形，先端微漸尖，長2.5-5毫米，背面近中部有橢圓形微凹的腺體；刺葉三葉交互輪生，斜展，疏松，披針形，先端漸尖，長6-12毫米，上面微凹，有兩條白粉帶。雌雄異株，稀同株，雄球花黃色，橢圓形，長2.5-3.5毫米，雄蕊5-7對，常有3-4花藥。球果近圓球形，徑6-8毫米，兩年成熟，熟時暗褐色，被白粉或白粉脫落，有1-4粒種子；種子卵圓形，扁，鈍，有棱脊及少數樹脂槽；子葉2枚，出土，條形，長1.3-1.5厘米，寬約1毫米，先端銳尖，下面有兩條白色氣孔帶，上面則不明顯。

檜柏材質致密，堅硬，桃紅色，美觀而有芳香，極耐久，故宜供作圖板、棺木、鉛筆、家具或建筑材料。種子可榨油，或入藥。因其生長速度中等而偏慢，故除作觀賞外，尚少用作大規模造林者。

由于栽培歷史悠久，為人注意，各地栽培的品種、變種很多，常見的有：

球檜：為叢生圓球形或扁球形灌木，葉多為鱗葉，小枝密生。
金葉檜：栽培變種，植株呈直立窄圓錐形灌木狀，全為鱗形葉，新生也全部為金黃色。
金心檜：栽培品種，為卵圓形無主干灌木，具2型葉，小枝頂部部分葉為金黃色。
龍檜：樹形不規正，枝交錯生長，少數大枝斜向扭轉，小枝緊密多為鱗葉，僅有時幾部萌生糵枝上有鉆形葉。
鹿角檜：叢生灌木，中心低矮，外側枝發達斜向外伸長，入鹿角分叉，多為緊密的鱗葉。
塔檜：樹冠塔狀圓柱形；枝不平展，多貼主干斜生，小枝密集，2型葉，以鉆形葉為多。亦名圓柱檜。

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