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合歡樹幼苗染枯萎病后，先是葉片變黃，然后根莖基部變軟，常出現倒伏，后全株枯死。成株染病的話，先是1-2根枝條出現癥狀，病枝上的葉片萎蔫下垂，葉色呈淡綠色或淡黃色，后期干枯脫落，隨后部分枝條開始干枯，逐步擴展到整株，至死亡。截開主干斷面，可見一整圈變色環，樹根部斷面呈褐色或黑褐色。
防治辦法是選擇抗病性強的品種，如淺色花的馳聞、深紅色花的夏洛特等，在種植形式上，好采取單株或幾株點綴種植于綠化帶、花園、庭院，不宜大面積或在街道上做行道樹，因為街道土壤堅實，排水不良。
做好合歡幼苗的病蟲害預防。當幼苗長出2—3片真葉時，噴1次甲胺磷2000倍液，防止螞蟻等害蟲危害幼苗，以后定時定量在葉面上噴灑葉面肥，提高苗木抗病能力。
選擇適宜生長的栽植地。 以土壤疏松、排水條件較好的地方種植，切忌低洼積水。
減少合歡樹的傷口，在日常養護管理中，盡量少剪枝，剪口要適當涂抹保護劑。移栽時，以移栽小苗為宜，因大樹移栽中的傷根多；大樹移栽時，減少起苗與運輸、定植時間，栽前對根部進行殺菌消毒，可噴灑40%多菌靈可濕性粉劑500倍液，或65%代森鋅可濕性粉劑500倍液。
合歡樹要進行藥劑處理，對癥狀輕微的病株，在更換土壤的同時結合藥劑處理進行控制。可采用70%甲基托布津可濕性粉、60%多·福可濕性粉100倍液噴灑樹干或涂抹；或使用14.5%多效靈水溶性粉劑、40%五氯硝基苯粉劑300倍液，以及抗枯寧、甲基托布津、多菌靈等農藥常規濃度澆灌土壤，每8天左右灌1次，連續3-4次可有效遏制病情擴展，并使植株逐步恢復；而使用70%基托布津可濕性粉劑300倍液，通過輸液的方式輸入植株內，可提高療效。在采取以上措施的同時，對樹穴及周圍相鄰土壤澆灌40%福美胂50倍液、40%五氯硝基苯粉劑300倍液，進行消毒，防止病菌蔓延。
