合歡樹的種子處理于第二年3-4月間，將種子作處理后方可播種。由于合歡種皮堅硬，為使種子發芽整齊，出土迅速，播前2周需用0.5%的高錳酸鉀冷水溶液浸泡2h，撈出后用清水沖洗干凈置于80℃左右的熱水中浸種30s（長不能超過1min，否則影響發芽率），24h后即可進行播種。利用這種方法催芽發芽率可達80%-90%，且出苗后生長健壯不易發病。

合歡樹在8月上旬以前要以施氮肥為主，后期（8月中下旬至9月間）以施用氮、磷、鉀等復混肥為主，用量為600-750kg/hm2，施肥時要按照“少量多次”的原則，不得施“猛肥”，以防肥多“燒苗”。由于合歡不耐水澇，故要在圃田內外開挖排水溝，做到能灌能排。若管理適當，當年苗高可達2000px以上。如作城鎮、園區綠化之用，要分床定植，苗期要及時修剪側枝，主干通直。

合歡患銹病后葉背會出現一些淡黃色斑點，斑點產生白色皰狀物。早期在皰狀物中散出銹褐黃色粉末，即病原菌的夏孢子堆。后期在皰狀物中散出暗褐色粉狀物，即病原菌的冬孢子。為金合歡球銹菌，擔子菌亞門、冬孢菌綱、銹菌目。每年發病在10月下旬至第2年4月間，病部產生的皰狀物開始時只有夏孢子堆，約1個月后，出現冬孢子堆。
防治辦法是噴灑0.3 石硫合劑，或75%百菌清可濕性粉劑400倍液，10-15天噴1次，連噴2-3次。

合歡樹枯萎病是一種系統性傳染病，對合歡樹來說是嚴重的病害。該病發生幾率較大，幼苗及成品樹都受到影響。其中，3-5年生樹易患枯萎病且發病速度快。另外，一些生命力弱的植株受此病影響，容易死亡。合歡枯萎病受氣候條件、土質和地勢、栽培環境及栽植管理的影響。高濕、多雨季節發病嚴重；土質粘重、地勢低洼、排水不良，積水地易發病；移栽或修剪等管理過程中造成的傷口，會增加鐮刀菌侵染機會。
做好合歡幼苗的病蟲害預防。當幼苗長出2—3片真葉時，噴1次甲胺磷2000倍液，防止螞蟻等害蟲危害幼苗，以后定時定量在葉面上噴灑葉面肥，提高苗木抗病能力。
選擇適宜生長的栽植地。 以土壤疏松、排水條件較好的地方種植，切忌低洼積水。
減少合歡樹的傷口，在日常養護管理中，盡量少剪枝，剪口要適當涂抹保護劑。移栽時，以移栽小苗為宜，因大樹移栽中的傷根多；大樹移栽時，減少起苗與運輸、定植時間，栽前對根部進行殺菌消毒，可噴灑40%多菌靈可濕性粉劑500倍液，或65%代森鋅可濕性粉劑500倍液。
合歡樹在移栽時，可用10%硫酸銅溶液蘸根處理，也可同時噴施生根粉等生長調節劑，以促進根系萌發生長。對于已截過的枝干斷面，涂抹保護劑，通過綁草加以保護，防治病菌侵入。栽后加強管理，立即灌透水，促進傷口及時愈合，在日常澆水、施肥等管理過程中盡量減少創傷口。旱時澆水，雨后排澇，定期施肥，增強植株長勢，提高抗病能力。
減少菌原感染，合歡樹盡量不在草坪中栽植，因草坪攜帶菌原對合歡會造成交叉感染；對栽入草坪中的合歡樹，要清除樹四周的草坪及雜草。在移栽前，盡量提前挖坑，高溫晾曬，用40%五氯硝基苯處理栽植坑土，尤其是對枯萎病高發區，進行土壤滅菌處理。