為了解決集裝箱進出口不平衡的問題，船公司通常要向出口大于進口的地區調撥大量空箱。由于空箱的調撥要增加大量調撥成本，船公司在空箱調撥進口至空箱裝貨出口的過程中更應加強集裝箱管理，避免超期箱的出現。在集裝箱運輸中空箱由進口到出口的整個流程可以歸結如下：
　冷藏集裝箱船舶進港→空箱卸船→碼頭堆存→集裝箱車隊拖箱→空箱進堆場→發貨人提箱→裝箱→重箱進港區→裝船。

要想有效地冷藏集裝箱超期箱的產生就在上文所分析的，導致集裝箱超期的環節上加強管理，全面提高各環節的工作效率。當然這其中存在許多客觀因素，而不是船公司或任何其他行為主體所能決定的。但船公司可以通過激烈的市場競爭選擇有利的合作方，通過相互間的密切合作來全面提高集裝箱流轉的效率。空箱卸船后，船公司及其代理應盡快完成進口空箱報關，然后委托車隊拖箱。其中船公司的委托指令要及時發下以備車隊去完成各項準備工作：如安排集裝箱卡車領取設備交接單等。船公司在選擇車隊時應該以車隊率的拖箱。

冷藏集裝箱根據制冷方式分類
(1)外置式冷藏集裝箱。無制冷裝置，箱體隔熱結構良好，箱端處有軟管連接器，可與船上或陸上冷凍站的制冷裝置連接，供給箱體冷源。
(2)內藏式冷藏集裝箱。箱體設有制冷裝置，由船上或陸上電源供電，或自備發電機供制冷裝置運行使用，以向集裝箱供冷。
(3)冷凍板冷藏集裝箱。利用冷凍板低溫共晶溶液進行蓄冷并向集裝箱提供冷源。
(4)液氮或干冰冷藏集裝箱。利用液氮噴淋或干冰向集裝箱提供冷源。
(5)氣調冷藏集裝箱。利用控制集裝箱內空氣中的氧、二氧化碳和乙烯等氣體的濃度，抑制果蔬的呼吸和催熟作用，并把向內溫度降至所需貯藏溫度的一種特種冷藏集裝箱。

冷藏集裝箱應注意溫度讀數的增加不會立即對貨物的實際溫度產生影響，也并不意味著制冷裝置處于不穩定狀態。電子數據記錄除了溫度以外，通常還會顯示除霜間隔和持續時間。如果裝貨溫度超過了設定溫度，冷藏裝置將會開始自動的將貨物溫度降至符合要求的溫度水平。如果貨物已經解凍，冷藏裝置將會嘗試降低貨物溫度但會持續頻繁進行除霜。

蔬菜水果適用于保鮮冷藏集裝箱，貨物需要預冷，冷藏集裝箱可不需要預冷。藏箱在運輸過程中是有一組柴油發電機供電，其安放在冷箱壓縮機的上方，而箱子到了堆場或是上船后是就是由堆場或船上的供電系統供電。
一、貨物預冷：貨物應進行預冷處理，并預冷到運輸要求的溫度。如果貨物溫度過高，將使制冷系統超負荷工作，導致該系統出現故障，影響貨物安全。
二、冷藏集裝箱：一般情況冷藏集裝箱不應預冷。但在冷庫的溫度與冷藏集裝箱內溫度一致，并采用“冷風通道”裝貨時，可以預冷集裝箱。
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需要注意的是，冷藏集裝箱租賃服務的價格通常會根據租期、租用數量和租賃公司的不同而有所差異。在選擇租賃公司時，客戶應該考慮租賃公司的信譽和服務質量，以確保貨物的安全和穩定運輸。