二手冷藏集裝箱在裝載水果時，可以考慮水果的呼吸作用和乙烯的催化作用來控制內部的交換。氣調法是指將果蔬以一般方法用氣密材料包裹，使果蔬依靠自身呼吸，使貯藏環境氣體含量達到適當標準，跳入氣體，保持各種氣體平衡。通過儀器檢測，可以檢測和調整冰箱內的氣體含量，冰箱內部的各種氣體成本與設定標準一致。

很多貨主在出口冷藏貨物裝箱的時候，會將冷藏集裝箱預冷到設定溫度，這種做法其實有可能會對貨物和冷藏集裝箱兩者都帶來不良影響，這是不科學的做法，會因此不能的集裝箱冷藏(凍)運輸。

冷藏集裝箱有外置式和內置式兩種，溫度可以在特定范圍內調節。內置型集裝箱在運輸中可以自由啟動制冷機，將集裝箱保持在溫度，另一方面，外置集裝箱需要集裝箱車、船、放置站所配備的制冷機。適合夏天運送黃油、巧克力、冷凍海鮮、煉乳等。

冷薏集裝箱租賃的期租分成長期性租用和短期內租用二種方法。集裝箱房屋長期性租用一般就是指有一段較長的租賃限期，而短期內租用則依據所需要的應用限期來租賃海運集裝箱，時間較為短。

為了避免冷藏集裝箱內壁面產生凝結水，可采取如下措施：
1． 如果箱內濕度正常，則應設法提高隔熱壁的內部熱阻（減小K值），或設法減小內表面的對流熱阻，以提高內壁面的溫度t2，例如增加箱內空氣流速。
2． 如果箱內空氣濕度很大時，采用上述方法是無效的。這時，應該在內壁面增加防水層，以免水分滲入隔熱壁內部。
至于隔熱壁內部結露，主要是由于箱內外水蒸氣的壓力差和隔熱壁的滲透性造成的。由于隔熱壁兩側空氣溫度的不同，即使兩側空氣的濕度相等，溫度高的一側空氣的水蒸氣分壓力也比溫度低的一側大。這樣就會產生水蒸氣分壓力差，此時水蒸氣將從水蒸氣分壓力高的一側通過隔熱壁向分壓力較低的一側滲透。

冷凍集裝箱是一具有良好隔熱，且能維持一定低溫要求，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱。專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。
冷凍集裝箱運送凍結貨時通常使用溫度應不-18℃。通常英尺冷凍集裝箱，平均降溫速度為31.3℃ /h（空箱）；但裝貨后，由于貨物熱容量較大，降溫速度會大大減慢，有時達到設定溫度要求需要15-16h。若進貨溫度較高，則達到設定溫度需要2-3d。
冷凍集裝箱箱內的溫度升、降速度與箱內裝載貨物有關，當達到設定溫度范圍-18℃±3℃后，應維持其箱內溫度的穩定。但在計算冷藏箱不制冷時箱內溫升時，可采用如下經驗公式作為標準值計算
1）冷卻貨（不通風時）0.0054*(tw-tn）℃/h
2）冷凍貨0.0067*（tw-tn) ℃/h式中tw和tn分別為外界溫度和箱內溫度℃。