使用冷藏集裝箱的時候，要注意在冷藏箱裝滿貨之后檢查一些原有的質量，這樣才會確保質量是合格的。在裝箱的過程中，要按照裝貨堆碼的原則，這樣才可以更好的避免冷風短路降溫的情況，從而可以提高制冷設備的制冷效果。

在購買二手冷藏集裝箱的時候一定要先來看看集裝箱有什么樣的來源，雖然集裝箱都是一樣的，但是在這之前應用的領域不一樣，所以大家盡量挑選一些使用領域相同的集裝箱。

為了避免冷藏集裝箱內壁面產生凝結水，可采取如下措施：
1． 如果箱內濕度正常，則應設法提高隔熱壁的內部熱阻（減小K值），或設法減小內表面的對流熱阻，以提高內壁面的溫度t2，例如增加箱內空氣流速。
2． 如果箱內空氣濕度很大時，采用上述方法是無效的。這時，應該在內壁面增加防水層，以免水分滲入隔熱壁內部。
至于隔熱壁內部結露，主要是由于箱內外水蒸氣的壓力差和隔熱壁的滲透性造成的。由于隔熱壁兩側空氣溫度的不同，即使兩側空氣的濕度相等，溫度高的一側空氣的水蒸氣分壓力也比溫度低的一側大。這樣會產生水蒸氣分壓力差，此時水蒸氣將從水蒸氣分壓力高的一側通過隔熱壁向分壓力較低的一側滲透。

上海缽滿集裝箱有限公司二手12米冷藏集裝箱制冷系統特點：
用于冷藏集裝箱的制冷系統，要符合以下幾項原則:
確保所裝運易腐貨物的運輸品質，滿足貨主的有關要求。
在一定的范圍內對其制冷量進行不間斷的調節。
對箱內溫度和濕度的控制能夠達到一定的精度。
適量的換氣，使箱內有合適的乙烯和二氧化碳濃度。
對箱內工況可以自動的檢測和記錄。

冷藏集裝箱（Reefer Container) 它是以運輸冷凍食品為主，能保持所定溫度的保溫集裝箱。它專為運輸如魚、肉、新鮮水果、蔬菜等食品而設計的。目前國際上采用的冷藏集裝箱基本兩種: 一種是集裝箱內帶有冷凍機的叫機械式冷藏集裝箱；另一種箱內沒有冷凍機而只有隔熱結構，即在集裝箱端壁上設有進氣孔和孔，箱子裝在艙中，由船舶的冷凍裝置供應冷氣，這種叫做離合式冷藏集裝箱（又稱外置式或夾箍式冷藏集裝箱）。

冷凍集裝箱是一具有良好隔熱，且能維持一定低溫要求，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱。專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。
冷凍集裝箱運送凍結貨時通常使用溫度應不-18℃。通常英尺冷凍集裝箱，平均降溫速度為31.3℃ /h（空箱）；但裝貨后，由于貨物熱容量較大，降溫速度會大大減慢，有時達到設定溫度要求需要15-16h。若進貨溫度較高，則達到設定溫度需要2-3d。
冷凍集裝箱箱內的溫度升、降速度與箱內裝載貨物有關，當達到設定溫度范圍-18℃±3℃后，應維持其箱內溫度的穩定。但在計算冷藏箱不制冷時箱內溫升時，可采用如下經驗公式作為標準值計算
1）冷卻貨（不通風時）0.0054*(tw-tn）℃/h
2）冷凍貨0.0067*（tw-tn) ℃/h式中tw和tn分別為外界溫度和箱內溫度℃。