內藏式冷藏集裝箱是在隔熱結構集裝箱內安裝冷凍機，無論在 船上、碼頭、陸運中，只要供給電源，箱內即可保持果蔬運輸所需 溫度。內藏式冷集裝箱目前都采用自動調節溫度，一般保持在零下 28°C的溫度范圍，所以應用較為廣泛，效果也佳。

冷藏集裝箱在貨物預冷時，將貨物溫度降至規定溫度，對冷藏集裝箱的冷卻溫度、空氣量、保鮮進行檢查，檢查內部、外部和底部結構，確認是否有損傷等，影響冷卻和保溫效果。保鮮貨物的冷藏溫度應在0℃以上，這對冷藏集裝箱要求較高。因為箱子里的動作狀態需要我們隨時掌握，所以制作時可以設定的一系列LED將用于動作狀態的通知。

冷藏集裝箱廣泛采用機械式制冷裝置，分為制冷式和冷藏式兩種。冷凍式冷藏集裝箱箱內溫度在-18℃以下，用于運輸冷凍食品，如豬肉、牛肉、魚和家禽。冷藏式冷藏集裝箱箱內的溫度一般為5℃~16℃，適合水果、蔬菜、花木等運輸。國際間通用的冷藏集裝箱一般是冷凍冷藏箱。冷凍裝置和加熱裝置可以根據使用要求任意調節箱內溫度，可以運輸冷凍食品，可以運輸冷卻食品或其他貨物。

冷藏集裝箱在冷卻過程中經常發生故障，造成這種故障的原因很多。例如，冷藏集裝箱在運行時設定的溫度與人工實測的溫度相同，但冷武箱溫度記錄表盤顯示的溫度和前者相差很大，表明溫度感溫探測器出現故障。雖然還有其他故障原因，但不管是什么原因，都要準備檢查和維修。

在二手冷藏集裝箱制冷裝置運行過程中，蒸發器盤管上會形成冰層，這取決于設定溫度、貨物溫度、通風裝置的新風量和貨物濕度。制冷裝置會定期進入除霜狀態，一系列電加熱裝置會產生熱量或向蒸發器盤管內吹入熱空氣。此時所有風扇將停止旋轉，以防止熱空氣進入貨艙。但是，由于回風溫度傳感器位于制冷機組附近，因此可能會記錄溫度升高。因此，除非經過數據記錄軟件處理，否則溫度記錄會顯示與除霜間隔一致的周期性溫升。如果除霜時間很短，每小時的溫度讀數和除霜時間可能會有一些差異。

很多貨主在出口冷藏(凍)貨物裝箱時，喜歡將集裝箱預冷至設定溫度，這種做法其實是不科學的，對貨物和集 裝箱都有可能帶來影響，從而不能的集裝箱冷藏(凍)運輸。原因是，如果裝貨前預冷過集裝箱， 那么在打開柜門準備裝貨時，外界高溫度、高濕度的空氣將會大量地進入柜內與低濕度、低溫度的空氣匯合，這 會使得大量的水珠凝結在集裝箱內壁上，這些水珠不僅會滴到貨物的外包裝上從而影響外包裝的美觀，而且會影 響集裝箱制冷系統的運作，從而有可能對貨物品質帶來不利影響。因為這些冷凝出來的水份由集裝箱制冷系 統中的蒸發器來排除，而這些冷凝出來的水份經過蒸發器盤管時會結冰、這將使得制冷系統進行一次短暫的除 霜過程。另一方面，蒸發器還除去以下三部分熱量：裝貨時通過柜門而直接進入柜內的熱量；穿過柜壁而透 進柜內的熱量；鮮貨活貨因新陳代謝而不斷產生的熱量。可以想象，如果冷藏集裝箱需要除去額外熱量和濕度越 多，那么主要應用來冷卻貨物本身的制冷量會越少。