冷藏集裝箱在貨物預冷時，將貨物溫度降至規定溫度，對冷藏集裝箱的冷卻溫度、空氣量、保鮮進行檢查，檢查內部、外部和底部結構，確認是否有損傷等，影響冷卻和保溫效果。保鮮貨物的冷藏溫度應在0℃以上，這對冷藏集裝箱要求較高。因為箱子里的動作狀態需要我們隨時掌握，所以制作時可以設定的一系列LED將用于動作狀態的通知。

很多貨主在出口冷藏貨物裝箱的時候，會將冷藏集裝箱預冷到設定溫度，這種做法其實有可能會對貨物和冷藏集裝箱兩者都帶來不良影響，這是不科學的做法，會因此不能的集裝箱冷藏(凍)運輸。

冷藏集裝箱有外置式和內置式兩種，溫度可以在特定范圍內調節。內置型集裝箱在運輸中可以自由啟動制冷機，將集裝箱保持在溫度，另一方面，外置集裝箱需要集裝箱車、船、放置站所配備的制冷機。適合夏天運送黃油、巧克力、冷凍海鮮、煉乳等。

冷藏集裝箱在冷卻過程中經常發生故障，造成這種故障的原因很多。例如，冷藏集裝箱在運行時設定的溫度與人工實測的溫度相同，但冷武箱溫度記錄表盤顯示的溫度和前者相差很大，表明溫度感溫探測器出現故障。雖然還有其他故障原因，但不管是什么原因，都要準備檢查和維修。

冷凍集裝箱是一具有良好隔熱，且能維持一定低溫要求，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱。專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。
冷凍集裝箱運送凍結貨時通常使用溫度應不-18℃。通常英尺冷凍集裝箱，平均降溫速度為31.3℃ /h（空箱）；但裝貨后，由于貨物熱容量較大，降溫速度會大大減慢，有時達到設定溫度要求需要15-16h。若進貨溫度較高，則達到設定溫度需要2-3d。
冷凍集裝箱箱內的溫度升、降速度與箱內裝載貨物有關，當達到設定溫度范圍-18℃±3℃后，應維持其箱內溫度的穩定。但在計算冷藏箱不制冷時箱內溫升時，可采用如下經驗公式作為標準值計算
1）冷卻貨（不通風時）0.0054*(tw-tn）℃/h
2）冷凍貨0.0067*（tw-tn) ℃/h式中tw和tn分別為外界溫度和箱內溫度℃。

冷藏集裝箱是一種能保持設定溫度的保溫容器，主要運輸冷凍食品。它是為運輸魚、肉、新鮮水果和蔬菜等食物而設計的。目前，國際上使用的冷藏集裝箱基本上有兩種：一種是機械冷藏集裝箱，集裝箱內裝有冰箱；另一種容器沒有冰箱，只有隔熱結構，即在容器的端壁上有進氣口和孔。箱體安裝在機艙內，冷風由船舶制冷裝置提供。這種集裝箱稱為離合器式冷藏集裝箱（也稱為外部或夾緊式冷藏集裝箱）。