冷藏集裝箱的陸上運輸工具中有溫控集裝箱的水運交通工具，以及運用更高運速的空中運輸工具。但是用戶在選擇以上三種運輸方式的時候，還應該仔細去考慮冷藏運輸多少錢這個問題，因為只有在不斷的對比和分析當中，才能選擇出適合自身的冷藏運輸方式。

為了解決集裝箱進出口不平衡的問題，船公司通常要向出口大于進口的地區調撥大量空箱。由于空箱的調撥要增加大量調撥成本，船公司在空箱調撥進口至空箱裝貨出口的過程中更應加強集裝箱管理，避免超期箱的出現。在集裝箱運輸中空箱由進口到出口的整個流程可以歸結如下：
　冷藏集裝箱船舶進港→空箱卸船→碼頭堆存→集裝箱車隊拖箱→空箱進堆場→發貨人提箱→裝箱→重箱進港區→裝船。

要想有效地冷藏集裝箱超期箱的產生就在上文所分析的，導致集裝箱超期的環節上加強管理，全面提高各環節的工作效率。當然這其中存在許多客觀因素，而不是船公司或任何其他行為主體所能決定的。但船公司可以通過激烈的市場競爭選擇有利的合作方，通過相互間的密切合作來全面提高集裝箱流轉的效率。空箱卸船后，船公司及其代理應盡快完成進口空箱報關，然后委托車隊拖箱。其中船公司的委托指令要及時發下以備車隊去完成各項準備工作：如安排集裝箱卡車領取設備交接單等。船公司在選擇車隊時應該以車隊率的拖箱。

冷藏集裝箱裝箱前準備工作：根據不同易腐貨物應確認下述事項：理想溫度設定;新鮮空氣換氣量設定;相對濕度設定;運輸總時間;貨物體積;采用的包裝材料和包裝尺寸;所需的文件和單證等。
裝箱前及裝貨時應注意：設定的溫度應正確;設定的新鮮空氣換氣量應正確;設定的相對濕度應正確;裝箱時制冷系統應停止工作;箱內堆裝的貨物應低于紅色裝載線和不超出T型槽的垂直面;箱內堆裝的貨物應牢固、穩妥;箱內堆裝貨物的總重量應不超過冷箱允許載重量;冷藏集裝箱裝貨后總重量(包括附屬設備的重量)在運輸途中不應超過任一途經國的限重。

冷藏集裝箱除了貨物的設定值和送風、回風溫度外，溫度控制系統還會以錯誤代碼的形式提供有關系統問題的詳細信息。貨物溫度可通過美國農業部（USDA）探測儀記錄，安裝該探測儀是為了符合美國農業部針對水果的運輸的冷藏處理程序。托運人放置于所載貨物中的數據記錄儀也會記錄大體溫度。當冷藏裝置失靈時，溫度顯示和數據記錄將會展示一個逐漸穩定的溫度上升直至終達到周圍環境溫度值過程。再次強調，感應器只會記錄空氣溫度，而非貨物溫度。貨物將會受到周圍絕熱材料一定的保護，防止受到外部空氣溫度的影響。

蔬菜水果適用于保鮮冷藏集裝箱，貨物需要預冷，冷藏集裝箱可不需要預冷。藏箱在運輸過程中是有一組柴油發電機供電，其安放在冷箱壓縮機的上方，而箱子到了堆場或是上船后是就是由堆場或船上的供電系統供電。
一、貨物預冷：貨物應進行預冷處理，并預冷到運輸要求的溫度。如果貨物溫度過高，將使制冷系統超負荷工作，導致該系統出現故障，影響貨物安全。
二、冷藏集裝箱：一般情況冷藏集裝箱不應預冷。但在冷庫的溫度與冷藏集裝箱內溫度一致，并采用“冷風通道”裝貨時，可以預冷集裝箱。
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