通常，冷藏貨物可以分成兩種：冷藏和冷凍
許多冷藏貨物（例如水果）被視為是“活性（live）”貨物，因為其在采摘過后仍然能夠進行呼吸并且由于自熱、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他條件而容易腐爛。然而，其它商品比如冷藏肉/魚類和奶酪則并非如此。水果的低設定溫度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷凍貨物通常被認為是“惰性(inert)”貨物，一般在-18℃（0°F）或更低溫度下運載。既然冷藏和冷凍貨物都是易腐爛的，就注意確保這類貨物以佳狀態交付。對于冷藏貨物，除了有限的幾種例外情況（比如肉，巧克力，膠片，化學物品，奶制品，人工氣調儲藏運輸貨物）外，其通風設備通常要保持開啟狀態。一些貨物可能要求濕度控制或者大量的新鮮空氣（比如球莖花卉）。應當注意大多數冷凍裝置僅能夠減少濕度，并且這取決于所提供的新鮮空氣的數量。人工氣調儲藏運輸的貨物需要使用能夠利用氮和二氧化碳替代氧氣水平的用途的集裝箱，來延長已采摘的產品的保質期。這種方法適用于許多有核和無核水果，但要求具備的知識來確定適宜的氣體濃度水平。

冷藏集裝箱的貨物檢查，在裝箱之前應對冷藏水果和蔬菜的溫度以及冷凍貨物的中心溫度進行檢測。還應檢查水果和蔬菜是否存在比如發霉、枯萎、脫水、萎蔫、褪色、軟點、破皮和脫皮、擦傷、凍傷和發臭等冷藏前的損壞。對于冷凍貨物還應檢查其是否有脫水、干燥、移位、發臭、黑斑和顏色改變，以及是否有因溫度升高解凍后又重新冷凍的跡象。還應檢查紙箱、托盤和其他包裝物狀況是否良好，是否能夠在整個海運過程中保護貨物狀況。

冷藏集裝箱裝箱前準備工作：根據不同易腐貨物應確認下述事項：理想溫度設定;新鮮空氣換氣量設定;相對濕度設定;運輸總時間;貨物體積;采用的包裝材料和包裝尺寸;所需的文件和單證等。
裝箱前及裝貨時應注意：設定的溫度應正確;設定的新鮮空氣換氣量應正確;設定的相對濕度應正確;裝箱時制冷系統應停止工作;箱內堆裝的貨物應低于紅色裝載線和不超出T型槽的垂直面;箱內堆裝的貨物應牢固、穩妥;箱內堆裝貨物的總重量應不超過冷箱允許載重量;冷藏集裝箱裝貨后總重量(包括附屬設備的重量)在運輸途中不應超過任一途經國的限重。

冷藏集裝箱裝貨注意事項
(1)冷凍集裝箱在裝貨過程中，在檢查冷凍裝置，確認冷凍機已停止運轉;
(2)貨物預冷：在裝貨前，要對冷凍集裝箱內使用的墊木和其他襯墊材料要預冷，并要對貨物應進行預冷處理，并預冷到運輸要求的溫度，因冷箱設計制冷能力有限，僅能用于保持貨物的溫度。如果貨物溫度過高，將使制冷系統超負荷工作，導致該系統出現故障，影響貨物運輸。

冷凍集裝箱的基本結構
(1)冷凍集裝箱隔熱層：構成箱體的6個面均包含隔熱層，不論是預制的隔熱板或者是現場發泡的隔熱層，均要求有必定的強度，更重要的是它有必要具有適當的隔熱才能和更高的密封功用。為滿意以上要求，應當防止呈現貫穿整個隔熱層厚度的金屬件，即熱橋(heat bridge),并在鉚釘和任何接縫處采取相應的密封辦法。
(2)箱頂：冷藏集裝箱頂的面板有必要是整塊的，不允許在這里呈現任何拼縫，以防外界的雨水或海水滲進隔熱層乃至進入箱體。在箱頂處還要防止呈現豎向的接縫。
(3)箱底：為了使箱內各部位的溫度均衡，在箱底結構的頂面，有必要敷設鋁質“工”字型斷面的通風軌板。在箱底的各個角部應設有供排出箱內凝結水和其它水分的疏水器或橡膠閥嘴(kazzo)，當閥內積水到達其容積的1/3~1/2時，會自行敞開并排出積水。它具有逆止功用，只能出水，不能逆向流入空氣。
(4)側壁結構：側壁的面積很大，對冷藏集裝箱的全體隔熱會有影響。通常其外側板可由鋁合金(t=1mm~2mm)、不銹鋼薄板(t=0.8mm~1.2mm);內側板一般選用不銹鋼板(t=0.6mm~0.8mm)、鋁板(陽氧化處理t=0.8mm~2mm)，或玻璃鋼板(t=1.5mm~2mm);外界水分對箱壁隔熱夾層的入侵將是潛在的，隔熱壁板的水分滲入，將導致該板的泡沫中空度下降，添加其本身分量，終會大大削弱其隔熱功用。因此在任何一個接縫處和鉚釘的周圍都有必要墊以密封帶并精心打好密封膠。整個箱體的內壁襯板應當由帶豎向波形的不銹鋼板構成。該波形的豎向布局是從底部通分軌板的頂面開端，上至箱內裝貨高限停止，以利箱內的涼風循環。
(5)箱門結構：冷藏集裝箱對箱門的結構設計和工藝要求很高。一般來講，箱內氣體經過箱門的走漏量，至少占全體走漏量的50%以上。由于箱門的周邊加上中心接縫的總量較長，在此處需求留意門板和后斷框架的空隙，并考慮設置雙層密封膠條。其外層膠條的斷面能夠象干貨箱那樣，而內層膠條的斷面將愈加雜亂，它的要作用是在水密的基礎上進一步到達氣密的要求。

二手冷藏集裝箱具有隔熱性強、氣密性強和可維持低溫的特點，可控溫度范圍零下-25℃~＋25℃之間，可以用于陸運，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱，它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱，可持續保溫72小時以上，適合裝載海鮮、生肉、蔬菜、水果、飲料、藥品、易腐蝕食品、化工原料等。