冷藏集裝箱有外置式和內置式兩種，溫度可以在特定范圍內調節。內置型集裝箱在運輸中可以自由啟動制冷機，將集裝箱保持在溫度，另一方面，外置集裝箱需要集裝箱車、船、放置站所配備的制冷機。適合夏天運送黃油、巧克力、冷凍海鮮、煉乳等。

冷藏集裝箱在冷卻過程中經常發生故障，造成這種故障的原因很多。例如，冷藏集裝箱在運行時設定的溫度與人工實測的溫度相同，但冷武箱溫度記錄表盤顯示的溫度和前者相差很大，表明溫度感溫探測器出現故障。雖然還有其他故障原因，但不管是什么原因，都要準備檢查和維修。

通常，冷藏集裝箱容器的平均冷卻速度為313℃/h空容器):但裝貨后，由于貨物的熱容量大，冷卻諫度將大大降低，有時需要15-16小時才能達到設定的溫度要求。如果輸入溫度很高，則需要2-3天才能達到設定溫度。

冷薏集裝箱租賃的期租分成長期性租用和短期內租用二種方法。集裝箱房屋長期性租用一般就是指有一段較長的租賃限期，而短期內租用則依據所需要的應用限期來租賃海運集裝箱，時間較為短。

冷凍集裝箱是一具有良好隔熱，且能維持一定低溫要求，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱。專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。
冷凍集裝箱運送凍結貨時通常使用溫度應不-18℃。通常英尺冷凍集裝箱，平均降溫速度為31.3℃ /h（空箱）；但裝貨后，由于貨物熱容量較大，降溫速度會大大減慢，有時達到設定溫度要求需要15-16h。若進貨溫度較高，則達到設定溫度需要2-3d。
冷凍集裝箱箱內的溫度升、降速度與箱內裝載貨物有關，當達到設定溫度范圍-18℃±3℃后，應維持其箱內溫度的穩定。但在計算冷藏箱不制冷時箱內溫升時，可采用如下經驗公式作為標準值計算
1）冷卻貨（不通風時）0.0054*(tw-tn）℃/h
2）冷凍貨0.0067*（tw-tn) ℃/h式中tw和tn分別為外界溫度和箱內溫度℃。

冷藏集裝箱促進食品冷鏈發展
冷藏集裝箱可通過各種運輸方式用于多式聯運。他們可以實現從原產地到銷售點的“國與國”直接運輸。在某些條件下，它們可以用作移動式冷庫。使用時可整體吊裝，裝卸，運輸成本相對較低。冷藏集裝箱的應用在一定程度上可以促進食品冷鏈的發展。