自動化立體倉庫的上游、下游及其內部各子系統的協調，有一個木桶效應的問題，即短的那一塊木板決定了木桶的容量。有的倉庫采用了很多的高科技產品，各種設施設備也非常，但是由于各子系統間協調性、兼容性不好，造成整體運作能力比預期差很多。

組成部分
1、貨架:用于存儲貨物的鋼結構。主要有焊接式貨架和組合式貨架兩種基本形式。
2、托盤（貨箱）：用于承載貨物的器具，亦稱工位器具。
3、巷道堆垛機:用于自動存取貨物的設備。按結構形式分為單立柱和雙立柱兩種基本形式；按服務方式分為直道、彎道和轉移車三種基本形式。
4、輸送機系統:立體庫的主要外圍設備，負責將貨物運送到堆垛機或從堆垛機將貨物移走。輸送機種類非常多，常見的有輥道輸送機，鏈條輸送機，升降臺，分配車，提升機，皮帶機等。
5、AGV系統:即自動導向小車。根據其導向方式分為感應式導向小車和激光導向小車。
6、自動控制系統:驅動自動化立體庫系統各設備的自動控制系統。以采用現場總線方式為控制模式為主。
7、儲存信息管理系統:亦稱中央計算機管理系統。是全自動化立體庫系統的核心。典型的自動化立體庫系統均采用大型的數據庫系統（如ORACLE，SYBASE等）構筑典型的客戶機/服務器體系，可以與其他系統（如ERP系統等）聯網或集成。

提高空間利用率
早期立體倉庫的構想，其基本出發點就是提高空間利用率，充分節約有限且寶貴的土地。在西方有些發達國家，提高空間利用率的觀點已有更廣泛深刻的含義，節約土地，已與節約能源、環境保護等更多的方面聯系起來。有些甚至把空間的利用率作為系統合理性和性考核的重要指標來對待。
立體庫的空間利用率與其規劃緊密相連。一般來說，自動化高架倉庫其空間利用率為普通平庫的2-5倍。這是相當可觀的。

隨著國家經濟的持續向好和對自動化立體倉庫需求較高的煙草、醫藥、機械等行業的持續快速增長，未來自動化立體倉庫面臨著較大的市場需求。以醫藥行業為例，據國家統計局數據顯示，截至2012年，中國工業總產值在2000萬以上的企業數量為6075家，以10%的需求量計算，醫藥行業對自動化立體倉庫的需求量就有607套，而保有量不足200套，市場前景可觀。

自動化管理提高了倉庫的管理水平。自動化立體倉庫采用計算機對貨品信息進行準確無誤的信息管理，減少了在存儲貨物中可能會出現的差錯，提高了工作效率。同時，立體自動化倉庫在入庫出庫的貨品運送中實現機動化，搬運工作安全可靠，減少了貨品的破損率，還能通過特殊設計使一些對環境有特殊要求的貨品能有很好的保存環境，比如有毒、易爆的貨品，也減少了人在搬運貨品時可能會受到的傷害。
自動化立體倉庫可以形成的生產鏈，促進了生產力的進步。人士指出，由于自動化立體倉庫的存取，因此可以有效地連接倉庫外地生產環節，可以在存儲中形成自動化的物流系統，從而形成有計劃有編排的生產鏈，使生產能力得到了大幅度的提升。