隨著冷藏冷凍集裝箱生產的發展和應用的普及，冷藏冷凍集裝箱的研究領域十分廣闊，
1、對冷藏冷凍集裝箱結構的研究，使箱體具有更高的強度、剛度、隔熱性能和通風系統。
2、冷藏冷凍集裝箱性能研究采用多方向、多控制參數的電子控制，采用微機及相應的電子元件對箱內空氣的溫度、濕度、空氣質量等參數進行綜合處理，實現跟蹤，箱內空氣參數的調節和控制。研究一種新的“新鮮空氣交換系統”，以可靠地監測箱內的空氣成分，有害氣體，補充新鮮空氣，調節空氣濕度，實現更有效的食品保存。
3、冷藏冷凍集裝箱制冷裝置的研究：制冷裝置在計算機的控制下工作，制冷壓縮機根據微機發出的熱負荷信號自動調節速度和制冷量，使冰箱保持在工作狀態。
4.為了執行有關保護大氣臭氧層的協議，有必要開展冷藏容器制冷劑更換的研究。
5、冷藏冷凍集裝箱熱性能測試系統軟件設計有待進一步優化。
6、冷藏冷凍集裝箱仿真研究。

為了避免冷藏冷凍集裝箱內壁面產生凝結水，可采取如下措施：
1． 如果箱內濕度正常，則應設法提高隔熱壁的內部熱阻（減小K值），或設法減小內表面的對流熱阻，以提高內壁面的溫度t2，例如增加箱內空氣流速。
2． 如果箱內空氣濕度很大時，采用上述方法是無效的。這時，應該在內壁面增加防水層，以免水分滲入隔熱壁內部。
至于隔熱壁內部結露，主要是由于箱內外水蒸氣的壓力差和隔熱壁的滲透性造成的。由于隔熱壁兩側空氣溫度的不同，即使兩側空氣的濕度相等，溫度高的一側空氣的水蒸氣分壓力也比溫度低的一側大。這樣會產生水蒸氣分壓力差，此時水蒸氣將從水蒸氣分壓力高的一側通過隔熱壁向分壓力較低的一側滲透。

冷藏冷凍集裝箱應注意溫度讀數的增加不會立即對貨物的實際溫度產生影響，也并不意味著制冷裝置處于不穩定狀態。電子數據記錄除了溫度以外，通常還會顯示除霜間隔和持續時間。如果裝貨溫度超過了設定溫度，冷藏裝置將會開始自動的將貨物溫度降至符合要求的溫度水平。如果貨物已經解凍，冷藏裝置將會嘗試降低貨物溫度但會持續頻繁進行除霜。

冷藏冷凍集裝箱除了貨物的設定值和送風、回風溫度外，溫度控制系統還會以錯誤代碼的形式提供有關系統問題的詳細信息。貨物溫度可通過美國農業部（USDA）探測儀記錄，安裝該探測儀是為了符合美國農業部針對水果的運輸的冷藏處理程序。托運人放置于所載貨物中的數據記錄儀也會記錄大體溫度。當冷藏裝置失靈時，溫度顯示和數據記錄將會展示一個逐漸穩定的溫度上升直至終達到周圍環境溫度值過程。再次強調，感應器只會記錄空氣溫度，而非貨物溫度。貨物將會受到周圍絕熱材料一定的保護，防止受到外部空氣溫度的影響。

冷藏冷凍集裝箱的貨物檢查，在裝箱之前應對冷藏水果和蔬菜的溫度以及冷凍貨物的中心溫度進行檢測。還應檢查水果和蔬菜是否存在比如發霉、枯萎、脫水、萎蔫、褪色、軟點、破皮和脫皮、擦傷、和發臭等冷藏前的損壞。對于冷凍貨物還應檢查其是否有脫水、干燥、移位、發臭、黑斑和顏色改變，以及是否有因溫度升高解凍后又重新冷凍的跡象。還應檢查紙箱、托盤和其他包裝物狀況是否良好，是否能夠在整個海運過程中保護貨物狀況。

使用冷藏冷凍集裝箱的時候，要注意在冷藏箱裝滿貨之后檢查一些原有的質量，這樣才會確保質量是合格的。在裝箱的過程中，要按照裝貨堆碼的原則，這樣才可以更好的避免冷風短路降溫的情況，從而可以提高制冷設備的制冷效果。