很多貨主在出口冷藏貨物裝箱的時候，會將冷藏集裝箱預冷到設定溫度，這種做法其實有可能會對貨物和冷藏集裝箱兩者都帶來不良影響，這是不科學的做法，會因此不能的集裝箱冷藏(凍)運輸。

在使用冷藏集裝箱之前，要注意以下幾點 1.不斷檢查集裝箱餐桌配件，確認配件處于正常狀態，發現問題及時上報，解決問題后才能投入運輸。 2、對凹地，要保護冷藏集裝箱內貨物，注意使用過程中的安全性 3、在使用冷藏集裝箱運輸之前，運輸公司應結合貨物的實際情況和鐵道部的規定，合理控制貨物重量，不要超過集裝箱承受的較大載荷。

為了避免冷藏集裝箱內壁面產生凝結水，可采取如下措施：
1． 如果箱內濕度正常，則應設法提高隔熱壁的內部熱阻（減小K值），或設法減小內表面的對流熱阻，以提高內壁面的溫度t2，例如增加箱內空氣流速。
2． 如果箱內空氣濕度很大時，采用上述方法是無效的。這時，應該在內壁面增加防水層，以免水分滲入隔熱壁內部。
至于隔熱壁內部結露，主要是由于箱內外水蒸氣的壓力差和隔熱壁的滲透性造成的。由于隔熱壁兩側空氣溫度的不同，即使兩側空氣的濕度相等，溫度高的一側空氣的水蒸氣分壓力也比溫度低的一側大。這樣就會產生水蒸氣分壓力差，此時水蒸氣將從水蒸氣分壓力高的一側通過隔熱壁向分壓力較低的一側滲透。

冷藏集裝箱的制冷方式
機械壓縮制冷：是當前成熟也是被廣泛應用的一種制冷方法，分電力驅動和自帶動力直接驅動兩種方式。當前可以滿足海上運輸，為解決陸上運輸中的能源問題，可以配置發電機組或掛裝電源。由于整套設備和系統比較復雜，維修工作量較大，管理費用較高。用于冷藏集裝箱的制冷機組（reefer unit）具有如下特點。
1.制冷量一般為3000~5000w。
2.壓縮機為半封閉或全封閉單級活塞式。
3.冷凝器為風冷式或水冷式。
4.由電力拖動，能適應200V和400V電壓，以及50Hz和60Hz周波的電源。
5.蒸發器為風冷式，其風機可以作有級變速。
6.用R22、R134a或R404A等非CFC冷劑，已經使用R12作為冷劑的現有機組考慮置換問題。
7.布局力求緊湊，盡量少地占據箱內空間，在既定橫截面的條件下，力求減少機組的厚度。

二手冷藏集裝箱：不同的貨物對集裝箱有不同的要求。例如，運輸鮮肉的冷藏車需要定制車廂上的掛鉤。冷鏈物流的平均運輸時間為3-4天，已成為必然趨勢。由于貨物批次小、品種多，配送到商店的冷藏車需要多層冷藏車。對于溫度要求不同、裝卸頻繁的貨物，需要開啟更多的冷藏車。隨著科學技術的進步和低溫制冷技術的發展，食品冷鏈是指易腐食品在繁殖、儲存、運輸、銷售和消費的各個環節始終處于規定的低溫環境中。

冷凍集裝箱是一具有良好隔熱，且能維持一定低溫要求，適用于各類易腐食品的運送、貯存的集裝箱。專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。
冷凍集裝箱運送凍結貨時通常使用溫度應不-18℃。通常英尺冷凍集裝箱，平均降溫速度為31.3℃ /h（空箱）；但裝貨后，由于貨物熱容量較大，降溫速度會大大減慢，有時達到設定溫度要求需要15-16h。若進貨溫度較高，則達到設定溫度需要2-3d。
冷凍集裝箱箱內的溫度升、降速度與箱內裝載貨物有關，當達到設定溫度范圍-18℃±3℃后，應維持其箱內溫度的穩定。但在計算冷藏箱不制冷時箱內溫升時，可采用如下經驗公式作為標準值計算
1）冷卻貨（不通風時）0.0054*(tw-tn）℃/h
2）冷凍貨0.0067*（tw-tn) ℃/h式中tw和tn分別為外界溫度和箱內溫度℃。