為提高冷卻效果，整個冷凍集裝箱的箱壁、箱頂和箱底內部，都鋪有絕緣材料。冷凍集裝箱工作的溫度在－28℃＋26℃之間，根據貨種的需要，可自動調節。保溫集裝箱主要用于裝載水果、蔬菜等鮮貨，一般是用干冰等冷卻劑，防止箱內溫度過度上升，通常的保溫時間為72小時左右。

我們通常見到的20英尺、40英尺集裝箱叫干貨集裝箱(Dry Cargo Container)，也叫雜貨集裝箱，還有人稱其為貨柜。這種集裝箱用來運輸無需控制溫度的件雜貨，使用范圍很廣，常用的有20英尺和40英尺兩種，還有一種加高了的40英尺集裝箱也屬于干貨集裝箱。這種集裝箱結構特點是常為封閉式。一般在一端或側面設有箱門，箱內設有一定的加固貨物的裝置，這種箱子在使用時要求箱內清潔、不滲水、漏水。對裝入的貨物要求有適當的包裝，以便充分利用集裝箱的箱容。

冷藏集裝箱也稱冷藏柜，是以運輸冷凍食品為主，能保持所定低溫的保溫集裝箱。它是專為運輸魚蝦、肉類、新鮮水果、蔬菜等食品而特殊設計的。目前國際上采用的冷藏集裝箱基本上分兩種:一種是集裝箱內帶有冷凍機的叫機械式冷藏集裝箱;另一種箱內沒有冷凍機而只有隔熱設備，集裝箱的端壁上設有進氣孔和出氣孔，箱子裝在船艙中后，由船舶的冷凍裝置供應冷氣，叫做離合式冷藏集裝箱（又稱外置式冷藏集裝箱）。

二手冷藏集裝箱是運輸需要保持一定溫度的冷凍貨或冷卻貨用的集裝箱。它在通常的外界溫度下能使箱內溫度保持在十25 - - 25 ℃ 之間的任一溫度上。制冷裝置的標準電源一般為440Vx 60Hz x3Φ，但裝有內藏變壓器以后，主要港口的電源一般都可使用。

冷藏集裝箱本身是沒有凍結能力的。因此原則上在裝載冷凍或冷卻貨時，一般在裝箱前要求對貨物進行預冷，使貨物溫度降低到給定溫度以下，然后裝箱。故正確地說，是一種帶有制冷裝置的，能把具有一定溫度的貨物保持在該溫度下進行運輸的絕熱集裝箱。在集裝箱的海一陸聯運中，為了率地發揮冷藏作用，要求冷藏集裝箱在整個運輸過程中使制冷裝置能自動啟動，以使箱內溫度保持在溫度上。

冷藏箱在制冷過程中經常會出現一些故障，導致這些故障的原因很多。常見的幾種故障及判定方法如下：　　　　 　　1、打開電源開關，如果制冷系統不工作，應檢查電源轉換開關是否在你選擇的電壓上，電源插座是否插好，保險絲是否損壞； 　　2、打開電源開關，制冷機各系統都在工作，但是不制冷。這種情況下一般是沒有制冷劑了； 　　3、開機后，制冷機工作幾分鐘就自動停機，幾分鐘之后又自動開機，這種情況下多是缺少制冷劑。如果開機后20分鐘以后，通過制冷劑顯示鏡可見氣泡，即屬于缺少制冷劑。如果，夏天出現自動停機情況，若不是缺少制冷劑，那么就是冷凝器灰塵太多，或者是由于制冷劑過多造成的。 　　4、制冷機正在工作，電腦不能儲存實際溫度，一般是制冷機的溫度感應器或電腦系統壞了。 　　5、冷藏集裝箱各系統工作正常，制冷狀況也正常，但是，反映在溫度記錄紙表盤上的溫度波動范圍太大。原因可能是：通氣口沒關閉、冷藏集裝箱門沒有關嚴、或者是冷藏集裝箱局部破損，導致箱內冷氣泄漏。 　　6、一般來說，冷藏箱的融霜周期是在制冷前設定的，在制冷過程中融霜的規律性很強。如果在執行融霜的時候出現持續融霜時間過長，則表明融霜控制開關壞了。如果融霜在制冷機工作期間終止，則表明加熱器壞了。 　　7、冷藏集裝箱正運行的時候，如果發現設定的溫度與人工在箱內實測溫度相同，而冷藏箱溫度記錄表盤顯示的溫度與前者相差過大，這表明溫度感溫探頭壞了。