利用冷藏集裝箱運輸水果時，應考慮水果的呼吸作用和乙烯的催化作用，控制冷藏集裝箱內的溫度。氣體法是一種比較普遍的方法，它意味著用氣密材料包裹果蔬，使果蔬不能與同一種氣體交流，果蔬根據自身的呼吸作用，使貯藏環境的氣體含量達到適當的標準。可以適當地跳入機身，保持各種機身的平衡。其次是連接基調法。該方法是指通過檢測設備檢測并調整冰箱內部的氣體含量，以使設定的基準與冷藏集裝箱內部的各種氣體的成分一致。

應當注意，溫度讀數的增加不會立即影響貨物的實際溫度，也不意味著制冷設備處于不穩定狀態。除了溫度，電子數據記錄通常還會顯示除霜間隔和持續時間。如果裝載溫度超過設定溫度，制冷裝置將開始自動將貨物的溫度降低到所需的溫度水平。如果貨物已經解凍，二手冷藏集裝箱的冰箱會試圖降低貨物的溫度，但會繼續頻繁解凍。

在二手冷藏集裝箱制冷裝置運行過程中，蒸發器盤管上會形成冰層，這取決于設定溫度、貨物溫度、通風裝置的新風量和貨物濕度。制冷裝置會定期進入除霜狀態，一系列電加熱裝置會產生熱量或向蒸發器盤管內吹入熱空氣。此時所有風扇將停止旋轉，以防止熱空氣進入貨艙。但是，由于回風溫度傳感器位于制冷機組附近，因此可能會記錄溫度升高。因此，除非經過數據記錄軟件處理，否則溫度記錄會顯示與除霜間隔一致的周期性溫升。如果除霜時間很短，每小時的溫度讀數和除霜時間可能會有一些差異。

二手集裝箱可用作二次利用的工具，質量較好的二手集裝箱，其實在經過簡單的翻新后，也可再次用作運輸工具。由于有些集裝箱只是因為年代久遠，或者是公司不再需要才被淘汰，其實并沒有什么嚴重的問題，仍然可以繼續使用。因此只需簡單的進行翻新，就能后續的使用效果，實用性還是不錯的。集裝箱再利用需要經過嚴格的檢驗才行，所以一定要對基礎進行確認，以免影響使用。

有時在行程時間較短的情況下使用的另一種制冷系統是全損耗制冷，其中使用冷凍的二氧化碳冰（或有時是液氮）進行冷卻。低溫冷凍的氣體緩慢蒸發，從而冷卻容器并從中排出。只要系統中有可用的冷凍氣體，容器就會被冷卻。這些已在軌道車中使用多年，可提供長達17天的溫度調節。雖然(上海冷藏集裝箱租賃)冷藏集裝箱在航空運輸中并不常見，但通常使用全損耗干冰系統。這些集裝箱有一個裝有固體二氧化碳的腔室，溫度由恒溫控制的電風扇調節，空運版本旨在保持溫度長達100小時左右。

冷藏集裝箱或冷藏箱是聯運集裝箱中使用的（運輸集裝箱）運輸貨物的運輸，其能夠制冷對溫度敏感，易腐貨物的運輸，如水果、蔬菜、肉類和其它類似的項目。配備這些“低溫”系統的全尺寸聯運集裝箱可以在海上運輸所需的30天內保持其溫度。由于它們不需要外部電源，因此低溫冷藏集裝箱(上海冷藏集裝箱租賃)可以存放在任何可以容納“干燥”（未冷藏）海運集裝箱的船只上的任何地方。