冷藏集裝箱租賃期間應進行檢驗，包括內外檢驗、箱門檢驗、清潔檢驗和配件檢驗。先，應檢查六個內外的損壞、變形、破損、漏水、漏光等情況，門、鎖是否完好，還應檢查是否有殘留物，是否、水痕、腐蝕氣味等。除此之外，還要檢查平臺容器的支腿、平臺容器、加強結構的容器頂部外延及其他附件是否完好。
1、外部檢查: 先，檢查集裝箱表面是否有損壞，檢查集裝箱頂部是否有氣孔和其他損壞，對于修復部件，檢查時應特別注意檢查其狀態，是否有泄漏。
2、內部檢查:關閉箱門，檢查是否漏光，這樣就容易發現箱頂和箱壁周圍是否有氣孔，箱門是否能關緊。檢查時注意箱壁內襯板上的無水濕痕。
3、箱門檢查：要檢查以及箱門能否可以順利進行開啟、關閉、開啟時能否實現正常轉運至270°，關閉后是否密縫，還要通過檢查箱門把手動作發展是否能夠靈活，箱門能否得到完全鎖上。
4、附件檢查：檢查系環、孔、板式機架容器、開頂式容器上使用的天篷和索具、儲液罐、水管、通風管、通風口是否。
5、清潔狀態檢查：檢查容器是否無垃圾、異味、銹蝕，是否有污垢，是否濕潤。當有屬于植物檢疫物的小麥鱗片、昆蟲和其他殘留物時，完全清除它們。

冷藏集裝箱廣泛采用機械式制冷裝置,有時又分冷凍式和冷藏式兩種。冷凍式冷藏集裝箱箱內溫度在-18℃以下,用于運送凍結食品,如豬肉、牛肉、魚、家禽等:冷藏式冷藏集裝箱箱內溫度一般在5℃~-16℃,適用于運送水果、蔬菜、花木等。國際間通用的冷藏集裝箱一般均為冷凍冷藏箱,制冷裝置和加熱裝置可以根據使用要求任意調節箱內溫度,即可運送凍食品,又可運送冷卻食品或其它貨物。

多貨主在出口冷藏貨物裝箱的時候，會將冷藏集裝箱預冷到設定溫度，這種做法其實有可能會對貨物和集裝箱兩者帶來不良影響，是不科學的做法，會因此不能的集裝箱冷藏（凍）運輸。

在進出口冷藏貨物裝箱的時候不要預冷集裝箱，這種情況高溫地區及夏天高溫季節裝箱時更要著重注意，好的方法是預冷貨物，然后將貨物從冷庫以及冷藏集裝箱兩者中隔熱通道迅速裝載進集裝箱。

冷藏集裝箱脫離制冷時間：各種運輸方式之間的交接可能出現短途運輸或制冷系統故障，造成停止制冷。對冷凍和冷藏保鮮貨物短時間地停止制冷狀態是允許的。許多產品出現幾小時的停止制冷可以接受，但并非所有貨物都如此。對任何冷藏貨物均不允許出現長時間地停止制冷。對特種貨物和溫度靈敏貨物應保持制冷系統連續工作，避免任何溫度波動造成貨物質量下降。

冷藏集裝箱裝箱前準備工作：根據不同易腐貨物應確認下述事項：理想溫度設定;新鮮空氣換氣量設定;相對濕度設定;運輸總時間;貨物體積;采用的包裝材料和包裝尺寸;所需的文件和單證等。
裝箱前及裝貨時應注意：設定的溫度應正確;設定的新鮮空氣換氣量應正確;設定的相對濕度應正確;裝箱時制冷系統應停止工作;箱內堆裝的貨物應低于紅色裝載線和不超出T型槽的垂直面;箱內堆裝的貨物應牢固、穩妥;箱內堆裝貨物的總重量應不超過冷箱允許載重量;冷藏集裝箱裝貨后總重量(包括附屬設備的重量)在運輸途中不應超過任一途經國的限重。