一個氨基酸的氨基與另一個氨基酸的羧基可以縮合成肽，形成的酰胺基在蛋白質化學中稱為肽鍵。氨基酸的分子小，蛋白質的大，兩個或以上的氨基酸脫水縮合形成若干個肽鍵從而組成一個肽，多個肽進行多級折疊就組成一個蛋白質分子。

長牡蠣 呈長片狀，背腹緣幾平行，長10-50cm，高4-15cm。右殼較小，鮮片堅厚，層狀或層紋狀排列，殼外面平坦或具數個凹陷，淡紫 色、 灰白色或黃褐色，內面瓷白色，殼頂二側無小齒。左殼凹下很深，鱗片較右殼粗大，殼頂附著面小。質硬，斷面層狀，潔白。無臭，味微咸。 大連灣牡蠣 呈類三角形，背腹緣呈八字形，右殼外面淡黃色，具疏松的同心鱗片，鱗片起伏成波浪狀，內面白色。左殼同心鱗片堅厚，自殼頂部放 射助數個，明顯，內面凹下呈盒狀，鉸合面小。近江牡蠣 呈圓形、卵圓形或三角形等。右殼外面稍不平，有灰、紫、棕、黃等色，環生同心鱗片， 幼體者鱗片薄而脆，多年生長后鱗片層層相疊，內面白色，邊緣有時淡紫色。

利用凝膠網狀結構， 根據分子大小和形狀差異進行分離的一種方法。當樣品進入凝膠柱后，較大分子不能通過孔道進入凝膠柱體內， 而與流動相一起流出層析柱，而小分子則滲入凝膠內。它具有分離條件溫和，產品收率高，生物活性好，分離面寬等優點，廣泛用于多肽物質的分離純化中。采用凝膠過濾色譜法分離分子量<1 200 da 的小肽。 進行分離收集分子量<1 200 da 的肽段，根據后蛋白含量數據， 分離得到的小肽居多，分離效果較好。通過柱層析分離出的分子量<1 200 da 的肽可以進一步采用液相制備色譜分離以獲得更高純度的肽產品。
一個氨基酸的氨基與另一個氨基酸的羧基可以縮合成肽，形成的酰胺基在蛋白質化學中稱為肽鍵。氨基酸的分子小，蛋白質，兩個或以上的氨基酸脫水縮合形成若干個肽鍵從而組成一個肽，多個肽進行多級折疊就組成一個蛋白質分子。蛋白質有時也被稱為“多肽個氨基酸相連為二肽，依此類推還有三肽、四肽 10個以下氨基酸組成的稱寡肽（小分子肽），超過十個就是多肽，而超過五十個就被稱為蛋白質。大分子蛋白質多是組成氨基酸超過100的長肽鏈。肽鍵就是氨基酸的α-羧基與相鄰的另一氨基酸的α-氨基脫水縮合的共價鍵，故肽鏈兩端有自由的α-氨基或α-羧基，分別稱為氨基末端或羧基末端。隨著組成氨基酸單元的不同，其性質和功能有很大差異小分子肽親水基團，又稱疏油基團，具有溶于水，或容易與水親和的原子團。可能吸引水分子或易溶解于水，
牡蠣肽是以新鮮牡蠣肉為原料，經酶解、分離、精制和干燥等加工過程而制得的相對分子量在1000Dalton的左右小分子分子低聚肽。牡蠣肽是由2~6個氨基酸組成的，相對分子量200~1000之間。因此，牡蠣肽可不經消化快速被人體吸收。牡蠣肽不僅含有豐富的蛋白質、維生素、比例合適的微量元素和牛磺酸，而且還含有海洋生物所有的多種營養成分，以及低聚肽具有較高的生物功能。
牡蠣肽與原蛋白（牡蠣蛋白）相比，兩者功能大不相同。，牡蠣肽具有活性高，在微量和低濃度的情況下，都能發揮其特的生理作用；其次，分子量小，不需消化，直接吸收：體外消化試驗表明：經胃蛋白酶和胰蛋白酶處理后，超過90以上牡蠣肽未被消化，說明在體內大部分將以多肽的形式被直接吸收。
近江牡蠣與大連灣牡蠣肉含糖元63.5%，牛磺酸（Taurine）1.3%，10種必需氨酸1.3%，無機鹽（銅、鋅、錳、鋇、磷、鈣）17.6%，谷胱甘肽（Glutathione），維生素A、B1、B2、D及F（即亞麻酸和亞油酸）。含碘1~11.53ppm（干重）。脂類中含一種糖脂，其糖由二分子葡萄糖和一分子巖藻糖構成。另有一種鞘類磷脂（Sphingo-lipid），含糖（葡萄糖、阿拉伯糖、巖藻糖）22.O%，氨基己糖（Hexosamine）7.26%，甲基戊糖（Methylpentose）10.45%，磷0.47% ，長牡蠣的脂類物質中含甾醇，它的氫化產物似為菜子甾醇（Brassicasterol）。