水冷散熱系統利用泵使散熱管中的冷卻液循環并進行散熱。在散熱器上的吸熱部分（在液冷系統中稱之為吸熱盒）用于從電腦CPU、北橋、顯卡上吸收熱量。吸熱部分吸收的熱量通過在機身背面設計的散熱器排到主機外面。
作為一種成熟的散熱技術，液冷散熱方式一直以來都被廣泛應用于工業途徑，如汽車，飛機引擎的散熱。將液冷散熱技術應用于計算機領域其實并非是因為風冷散熱已經發展到了盡頭，而是由于液體的散熱速度遠遠大于空氣，因此液冷散熱器往往具備不錯的散熱效果，同時在噪音方面也能得到很好的控制。由于在散熱效率和靜音等方面有著的種種優勢，在計算機風冷散熱流行不久后，液冷散熱也隨之出現。令人可喜的是，時至今日，計算機領域的液冷散熱正在普及開來，這種狀況歸根結于液冷的安全性和穩定性有了很大的進步。
液冷還有一個很重要的好處就是液體的熱容量大，溫升慢，有利于計算機在出現突發事件時確保不會瞬間燒毀CPU。 從開機后，溫度緩慢上升，而風冷的溫度是很快上升到一個穩定值，而在CPU有大型運算等突發事件時，尖峰可能會瞬間突破CPU的溫度上限。而液冷則可以將這個尖峰很好的過濾掉，CPU的安全。
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