區域劃分：遵循潔污分開原則，清潔區設專職收集人員的工作室、物品室；半清潔區設清洗消毒與暫存室，用來清洗、消毒和存放轉運車輛與工具；污染區設存放醫療廢物的房間，室內分設感染性廢物、病理性廢物、損傷性廢物、藥物性廢物及化學性廢物存放區，標識明確。
醫廢間即醫療廢物暫存間，是醫療機構中用來暫時存放從醫療廢物產生地點收集來的醫療廢物的場所，以下是關于醫廢間的詳細介紹：
設置要求
選址：應在醫療機構偏僻區域，處于主風向下風位置，周邊地勢，有良好的排漬條件，遠離高壓線、高溫設施設備，與醫療區、食品加工區、人員活動密集區和生活垃圾存放場所相距 20m 以上，方便醫療廢物的裝卸及車輛出入。
布局及功能分區：一般分為廢物存放區、工具處置區、更衣辦公區，并預留緩沖區。
建筑：使用面積應與機構規模及實際醫療廢物產生量相適應，主體結構完整，耐火等級不低于三級，出入口無門檻，能上鎖或設門禁，室內外地面硬化，室內地面防滲，墻裙 1.5m 以下防水，窗沿距地面高度不小于 1.5m，有防盜、防蚊蠅、防蟑螂、防鼠等裝置，污水排水管直接連通污水站。
設施：應有清洗設施、紫外線燈，自然通風，通風不良時增加機械通風并加裝電路保護裝置，自然采光不佳時增加輔助照明燈具，按要求配置醫療廢物存儲容器（周轉箱），存放藥物性、病理性醫療廢物等的冰柜或冰箱應有溫度顯示。
根據《醫療廢物管理條例》規定，醫療廢物暫時貯存的時間不得超過 2 天。
在實際操作中，盡量做到日產日清。如果當地高氣溫 25℃，且確實不能做到日產日清時，應將醫療廢物低溫暫時貯存，暫時貯存溫度應低于 20℃，時間長不超過 48 小時。
此外，在重大傳染病等突發事件期間，一些地方會出臺更嚴格的規定，如廣東省規定肺炎醫療廢物暫存時間不超過 24 小時，處置單位醫療廢物貯存不得超 12 小時；西寧市規定新型冠狀病毒感染相關醫療廢物貯存不得超過 24 小時，在處置單位的暫存時間不得超過 12 小時
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