果膠酯酶常用于果汁的澄清、果酒的釀造等過程，通過分解果膠改善產品的質地和口感。此外，在乳制品或糕點餡料中加入經果膠酯酶處理的水果，可以提高水果的硬度和穩定性

果膠酯酶的活性測定通常是以果膠為底物，通過測定在一定條件下產生的羧基（常用NaOH滴定）或甲醇的量來確定其活性?。

通過測定果膠酶制劑對果膠作用后粘度下降的百分率來確定酶活力。將酶液加入到含果膠的緩沖液中，反應一段時間后，用粘度計測定反應液的流下時間，與空白試驗對比計算酶活力?