全球每年產生大量廚房廢油，但由于來源分散，回收難度加大。據統計，原材料收集成本占生物燃料成本的70%-80%。然而，木本油料植物受季節影響，難以維持可持續供應。糧食原料存在著“人爭糧”、“人爭地”的問題。現有油料作物不符合生長周期短、含油量高的特點。

即所有轉化過程將不可避免地導致新的污染源，包括二氧化碳和其他污染物的排放；如果煉油后的廢渣，特別是煉油廢油的廢渣處理不當，也會造成污染，治理污染的成本終會增加到成品油的價格中。

打破生物燃料現狀的途徑作為一種新興的能源生物燃料，現階段完全取代航空煤油是不現實的。歸根結底，使用哪種燃料取決于成本。因此，在技術不斷突破的前提下，如何建立完善的產業，大規模降低成本，是生物燃料發展的關鍵。

此外，可以制定政策，引導消費者積極參與生物燃料的使用。歐盟航空公司開發了碳排放交易系統，并為航空公司規定了碳排放配額。在該系統中，以2004年至2006年往返歐盟的航空公司的年平均碳排放量作為該航空公司的排放基線。

20世紀70年代，美國能源部為了發展可持續能源，對微藻進行了大規模的收集、篩選和鑒定，終獲得了300多種產油微藻，即脂類占細胞干重20%以上的微藻。其中，小球藻微球菌的脂比高達68%。據估計，藻類的年產油量可達到每公頃養殖面積15000至80000升。

為什么微囊藻有如此高的脂比？答案在于其特的碳封存能力。光合作用是自然界生物固碳的基礎。地球上每分鐘大約有300萬噸二氧化碳和110萬噸水可以通過光合作用轉化為200萬噸有機物，同時可以釋放210萬噸氧氣。