主要起儲存糞液的作用。經格處理的糞液進入第三池，基本上已經不含寄生蟲卵和病原微生物，達到了糞便無害化要求，可以供農田直接施肥。

貯糞池由二根過糞管連通的三個格室的密封池組成。根據其主要功能依次可命名為截留沉淀與發酵池、再次發酵池和貯糞池。三池之間由過糞管連接。有斜插管及倒U形、倒L形管等，但以斜插管為。過糞管采用內徑為100～150mmPVC塑料管為宜，也可以用水泥預制、陶管等其它材料、要求內壁光滑。為防止堵塞，考慮糞池的大小與流量，可適當增加過糞管的數量。

過糞管安裝的位置關系到糞便流動方向，流程長短，是否有利于厭氧和能否有效阻流糞皮、糞渣、以及保持一、二池的有效容積，新鮮糞便進入糞池后，多集中在上層形成糞皮，然后逐漸疏松崩解，比重較大的下沉形成糞渣，糞皮與糞渣之間為稀糞液。寄生蟲卵一般都集中在糞皮和糞渣中，因此，過糞管位置要放在寄生蟲卵較少的中層糞液。過糞管位置較好的設置應分別斜插安裝在兩堵隔墻上：其中池到第二池過糞管下端位置在池的下1/3處，上端在第二池距池頂100mm左右：第二池到第三池過糞管下端位置在第二池的下端1/3或中部1/2處、上端在第三池距池頂100左右，過糞管與隔墻的水平夾角應呈60度。附有關平面圖。

建造要點 （一）防滲漏 （二）過糞管主要材料為：水泥管、陶管或塑料管，按要求安裝成//型、倒L型或倒T型，安裝完成后用摻5%防水粉的1：2水泥砂漿封口。 （三）糞池砌體安裝完成后，應先將糞池蓋蓋好，再回填土并分層夯實。 （四）糞池的上沿要高出地面150mm，防止雨水流入化糞池。 （五）池蓋大小要適宜，便于出糞清渣的開啟。 （六）廁屋的位置應選在廚房的下風向。 （七）在廁屋內安裝排氣通風設備

清理要求 1）糞便轉運站(場、碼頭)設施應完好、整潔。轉運的糞污水應密閉貯存于貯糞池內。貯糞池應符合防滲漏、防臭氣擴散和防蠅的要求，并設置防火、防爆安全設施。 2）貯糞池內的糞便應及時轉運，不得外溢。 3）輸糞管道應完好、暢通，閘閥應嚴密，無破損、滴漏。 4）轉運作業時，糞便不得污染水體和作業場地。沖洗作業場地的污水應經適當處理，排入污水管網或收集池，不得直接排入附近水體。 5） 將人力收集車的糞便轉運到機動車時，應保持轉運作業的緊密銜接，不得任意將糞罐、糞桶、手推糞車停放在主要道路上。 6）卸糞時應謹慎操作，不得將糞便潑灑在卸糞口周圍地面。作業結束，應及時清洗卸糞口及作業場地。 7）糞便轉運站(場、碼頭)應有滅蠅措施。在可視范圍內，蒼蠅不超過3只/次，無蛆，臭味不超過4級。

設備清理準備與化糞池容積相同的吸糞車，將吸糞管放到化糞池的內部然后啟動開關，內部的化糞結塊基本上完全被吸完，然后使用水管清洗化糞池內部，排出多余的污水，再清洗化糞池的設備以及工具，蓋好蓋板，井內無積物浮在上面保持出入口暢通，污水不會溢出地面，清理化糞池的工作就完成了