在臨床上，水飛薊素常用于治療急慢性肝炎、肝硬化及中毒性肝損傷等肝臟疾病?。也被用作抗脂肪肝藥，用于支持治療中毒性肝臟損傷、慢性肝炎及肝硬化等

水飛薊素對肝臟具有保護作用，能夠減輕肝臟損傷，并促進肝細胞的修復和再生。這種保護作用有助于維持肝臟的正常生理功能，包括功能

水飛薊素中的活性成分，如水飛薊賓，是天然的活性護肝因子。這些成分能夠與肝細胞的胞膜結合，通過抗脂質過氧化反應維持細胞膜的流動性，從而減輕有毒物質對肝細胞膜的攻擊。這種保護作用不僅中斷了有毒物質的跨膜轉運和細胞間傳播，還有效增強了肝細胞對多種有毒物質的抵抗力。同時，水飛薊素還能促進結構蛋白的合成，間接促進細胞DNA的合成，這進一步利于肝細胞的修復和再生