儲存與運輸：原料應儲存在干燥、通風、陰涼的環境中，防止受潮、發霉和氧化。運輸過程中也要注意保持適宜的條件，避免原料受到污染或損壞。
定期對干燥設備進行維護保養，檢查設備的加熱系統、通風系統、制冷系統等是否正常運行，確保設備處于良好的工作狀態，以干燥效果和產品質量的穩定性。
應配備有效的粉塵收集裝置，如旋風分離器、布袋除塵器等，及時收集干燥過程中產生的粉塵，并定期清理粉塵收集裝置，確保其正常運行。同時，要保持干燥車間的通風良好，降低粉塵濃度。
脫膠：向提取得到的粗卵磷脂中加入適量的水或磷酸等脫膠劑，使其中的磷脂等膠溶性雜質凝聚沉淀，然后通過過濾或離心分離的方法將其去除。
脫臭：采用減壓蒸餾的方法，在高溫、高真空條件下，將卵磷脂中的異味物質去除，得到氣味的精煉卵磷脂。
脫色：將經過脫膠、脫酸處理的卵磷脂通過活性炭或活性白土等吸附劑進行脫色處理，去除其中的色素和其他雜質，使卵磷脂的顏色變淺，提高產品的外觀質量。
