1.自控設備及元件：采用多功能數字控制器，結合溫濕度傳感器、電動調節水閥、風閥執行器等控制設備，對系統的風量、溫度、濕度進行控制。
2.溫度控制：溫濕度傳感器檢測室內回風溫度，送往控制器，控制器將傳感器信號與溫度設定值進行比較，輸出控制信號控制電動調節水閥及電加熱，控制凈化空調機組的送風溫度。
3.濕度控制：溫濕度傳感器檢測室內回度，送往控制器，控制器將傳感器信號與濕度設定值進行比較，輸出控制信號控制電動調節水閥、電加熱及加濕器，控制凈化空調機組的送度。
4.凈化空調機組風機電機控制：變頻啟動；正常高速運行，值班工況低速運行；實現變頻、定頻、應急通風三種運轉模式；壓差傳感器檢測系統阻力變化，變頻器相應自動調整風機馬達轉速減少正常運行時的能耗。
5.遠程監控：設室內控制面板，可實現：風機電機運行、故障狀態監控；過濾器堵塞壓差監控；遠程啟停、值班控制及正負壓轉換控制（僅正負壓切換病房室有），溫、濕度顯示及溫度調節功能。
6.機房本地控制：配置智能控制柜，除了實現室內控制面板所有功能外，還可實現：控制參數修改，各級過濾器壓差堵塞監控，系統缺風壓差監控，電加熱高溫報警監控，加濕器等各種設備運行、故障狀態監控。

a.凈化自取新風系統
自取新風凈化循環機組冷熱盤管的回水總管上配置比例積分電動調節三通閥，新風入口風管、回風主管上設置溫、濕度傳感器；傳感器均需安裝在風管直管段 上，不得安裝于彎頭位置。
溫、濕度探頭采集到信號后傳遞給自動控制器，自動控制器再通過所設定的溫度、濕度要求來控制三通調節閥的開啟度、再熱的運行。
自動控制器實行濕度控制。在夏季工況下：新風與回風混合之后，通過機組的表冷盤管進行降溫除濕，再通過機組再熱加熱到設計的送風狀態點送風；在 冬季工況下：室外新風低于5℃時，新風經機組預熱到5℃后，通過盤管加熱到設定溫度值后，再通過加濕器加濕，直到溫、濕度滿足自動控制器設定的值送風。

空調自控系統是一種自動控制室內溫度的系統，它能夠自動根據室內溫度變化，調節空調機組的動作，以達到設定的溫度。該系統由溫控器、空調機組、運行狀態監測儀表等組成，它的工作原理是將溫度傳感器放置于室內，實時檢測室內溫度，將溫度信號輸入溫控器，溫控器將控制信號發送到空調機組，控制機組運行，從而達到設定的溫度要求。

7.潔凈區采用凈化組合式空調機組，機組配備帶冷盤管和熱盤管，熱盤管兼顧夏季再熱使用，冬季加濕采用電極加濕器。
8.室外新風送入組合式空調機組，經處理后送入各潔凈室，各潔凈室回/排風再由下部排風口排出室外。
9、自動控制器實行溫度控制，在夏季工況下：新風進入凈化空調機組,在凈化空調機組中進行降溫除濕至機器露點，再通過輔助風管電加熱器加熱到設計的送風狀態點，送風。
10、排風機與凈化空調機組實現連鎖控制，即凈化空調機組開啟，所對應的潔凈區的排風機亦開啟，當凈化空調機組關閉后，所對應的排風機也相應的關閉。
16.缺風保護：在送風機前后設置缺風保護壓差開關，對加熱器、加濕器實現保護，即缺風保護壓差開關不接通，則上述加熱器、加濕器不得投入工作；且如果開機3分鐘后缺風保護壓差開關仍未接通，則發出缺風故障報警；
18、停機延時：需關閉和空調系統時，先關掉加熱、加濕、送風機延時3分鐘后關閉，以清除機組內殘留的余熱余濕；
19、過濾器壓差報警：在過濾器前后設置壓差開關，當過濾器前后壓差超過設定值時報警指示；
20、掉電保護：加熱電動調節閥/加濕器電動執行器均為斷電復位型，系統突然掉電時，可以自行關閉；
21、電氣安全保護：為機組安全可靠運行，機組控制柜提供以下安全保護功能：電機過載保護，電源、運行及過載報警指示，具有遠程/就地控制轉換功能；
22、防凍保護：有防凍措施和報警功能；

1. 空調機組共設4種狀態：正常運行，消毒運行，值班運行，關機。要求控制柜和上位機上均能實現模式轉換。2. 空調箱風機配自動變頻器，由設在送風總管上的風量傳感器來調節變頻器工作狀態，使送風量達到設定值。3. 正常運行時：a:風量控制：由設在送風總管上的風量傳感器來調節變頻器工作狀態，使送風量達到設計值。b:溫濕度控制：調節冷凍水管路、蒸汽加熱管路和蒸汽加濕管路的閥門開度，實現回風恒溫恒濕控制（溫濕度參數可調）。c:電動閥門控制：回風電動閥開啟，臭氧電磁閥關閉。d:設備啟停控制：空調機組運行，臭氧發生器關閉。4. 消毒運行時：a:風量控制：由設在送風總管上的風量傳感器來調節變頻器工作狀態，使送風量達到設計值的1/2。b:溫濕度控制：調節冷凍水管路、蒸汽加熱和加濕管路的閥門開度，實現回風恒溫恒濕控制（溫濕度參數可調）。c:電動閥門控制：臭氧電磁閥開啟，排風電動閥關閉。d:設備啟停控制：空調機組正常運行，臭氧發生器正常運行。5. 值班運行時：a:風量控制：由設在送風總管上的風量傳感器來調節變頻器工作狀態，使送風量達到設計值的1/4。b:溫濕度控制：調節冷凍水管路、蒸汽加熱管路和蒸汽加濕管路的閥門開度，實現回風恒溫恒濕控制（溫濕度參數可調）。c:電動閥門控制：回風電動閥開啟，臭氧電磁閥關閉。d:設備啟停控制：空調機組運行，臭氧發生器關閉。

．自動化系統內容包括BMS建筑管理系統中空調系統的自動控制與房間環境監測末端點位通過硬接線/通信線至各樓層對應PLC柜，再通過網線/光纖至BMS系統機房。功能上可監可控，結果上須調試至需要的效果。設計單位明示控制要求及原理，具體自控圖紙由包商深化。自控系統BMS機房位置暫定與負一層弱電機房合并設置，布置參考自控構架圖，具體由包商確認并深化；線纜沿弱電橋架/出橋架穿管敷設，橋架未及或空間不足，由包商自行敷設橋架/穿管。設計未及之處，依照國家規范標準施工。 環境監測系統本工程環境監測系統用于潔凈區內關鍵房間的溫溫度、房間差壓的實時監控和報警。當采集到的測量數據值超過環境監測系統中可接受的參數設定值時，系統將自動觸發報警并且通知操作人員。所有測量的原始數據值和報警信息將自動記錄并且存僧在環境監測系統的歷史數據服務器。要求原始數據值可通過以時間為參數的曲線方式記錄以便使用方調用。環境監測系統設備組成溫度傳感器／變送器、濕度傳感器／變送器、壓差傳感器／變送器、各氣體探測器顯示面板要求能顯示并計量溫度、濕度、壓差三類數據，需額外考慮點位需求。環境監測系統監測內容潔凈區域房間相對壓差監測房間溫／濕度監測動物實驗室氨濃度探測、CO2使用點CO2濃度探測現場聲光報警：關鍵工藝區域設聲光報警器（詳見各原理圖），用于動物實驗室環境及CO2濃度報警。