空調自控系統是一種自動控制室內溫度的系統，它能夠自動根據室內溫度變化，調節空調機組的動作，以達到設定的溫度。該系統由溫控器、空調機組、運行狀態監測儀表等組成，它的工作原理是將溫度傳感器放置于室內，實時檢測室內溫度，將溫度信號輸入溫控器，溫控器將控制信號發送到空調機組，控制機組運行，從而達到設定的溫度要求。

7.潔凈區采用凈化組合式空調機組，機組配備帶冷盤管和熱盤管，熱盤管兼顧夏季再熱使用，冬季加濕采用電極加濕器。
8.室外新風送入組合式空調機組，經處理后送入各潔凈室，各潔凈室回/排風再由下部排風口排出室外。
9、自動控制器實行溫度控制，在夏季工況下：新風進入凈化空調機組,在凈化空調機組中進行降溫除濕至機器露點，再通過輔助風管電加熱器加熱到設計的送風狀態點，送風。
10、排風機與凈化空調機組實現連鎖控制，即凈化空調機組開啟，所對應的潔凈區的排風機亦開啟，當凈化空調機組關閉后，所對應的排風機也相應的關閉。
16.缺風保護：在送風機前后設置缺風保護壓差開關，對加熱器、加濕器實現保護，即缺風保護壓差開關不接通，則上述加熱器、加濕器不得投入工作；且如果開機3分鐘后缺風保護壓差開關仍未接通，則發出缺風故障報警；
18、停機延時：需關閉和空調系統時，先關掉加熱、加濕、送風機延時3分鐘后關閉，以清除機組內殘留的余熱余濕；
19、過濾器壓差報警：在過濾器前后設置壓差開關，當過濾器前后壓差超過設定值時報警指示；
20、掉電保護：加熱電動調節閥/加濕器電動執行器均為斷電復位型，系統突然掉電時，可以自行關閉；
21、電氣安全保護：為機組安全可靠運行，機組控制柜提供以下安全保護功能：電機過載保護，電源、運行及過載報警指示，具有遠程/就地控制轉換功能；
22、防凍保護：有防凍措施和報警功能；

1.防火調節閥與送排風機聯鎖, 當風管內空氣溫度達到70°C時, 防火調節閥自動關閉,同時切斷送排風機電源, 并將信號傳至值班室。 另外,當消防值班室接到火警信號時,也可由消防人員手動遠距離關閉防火調節閥, 并切斷送排風機電源。2.空調系統的初效,中效過濾器壓差現場顯示，當過濾器阻力大于下列值時清洗或更換: 初效過濾器的壓差>80Pa, 中效過濾器的壓差>160Pa。過濾器進行壓差報警，當過濾器阻力>400Pa時報警，過濾器需要進行更換。FFU過濾器進行壓差報警，當過濾器阻力>180Pa時報警，過濾器需要進行更換。3.正壓控制：新風機組的風機設置自動變頻控制室內的正壓，當總管正壓值大于350Pa時（通過現場調試設定），減小風機變頻器的頻率。當正壓值小于350Pa時，加大變頻器的頻率。房間內正壓的控制，通過安裝在房間吊頂上壓差傳感器控制對應房間吊頂上新風電動閥的開度。4.室內溫濕度控制：當室外露點溫度大于11.8°C時，為夏季；當室外露點溫度低于11.8°C時且其干球溫度低于18°C時，為冬季；其它工況為過渡季節。（1）夏季工況：a.電動閥MV-M101-1、MZ-M101-1關閉，電動二通閥MV-M101-2、MV-M101-3、MV-M101-4開啟；系統處于制冷工況。b.設定干球溫度傳感器T1溫度為20°C，當T1溫度20°C時，電動二通閥MV-M101-2開大，當T1溫度低于20°C時，電動二通閥MV-M101-2關小。c.設定出風露點傳感器Td溫度為11.8°C，當Td溫度11.8°C時，電動二通閥MV-M101-3開大；當Td溫度低于11.8°C時，電動二通閥MV-M101-3關小；d.設定出風干球溫度傳感器T2溫度為18°C，當T2溫度18°C時，電動二通閥MV-M101-4關小；當T2溫度低于18°C時，電動二通閥MV-M101-4開大；（可根據實際情況調整出風溫度或關閉電動閥MV-M101-4直接露點送風，出風露點也可根據實際情況微調）