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枯草芽孢桿菌對植物病蟲害具有一定的防治作用，與傳統的化學農藥相比，對人畜無害，不污染環境，廣譜，無抗逆性。
枯草芽孢桿菌目前已被制成粉劑可濕性粉劑等被應用，運用枯草芽孢桿菌制成的可濕性粉劑噴施于茶樹上，不僅可提高機體的能力，還具有明顯的提質增產作用。
研究表明，枯草芽孢桿菌可有效防治草莓白粉病，可提高作物品質和產量；將枯草芽孢桿菌和蘇云金芽孢桿菌進行細胞融合獲得了具有殺蟲作用的融合子CF103，田間試驗結果顯示，CF103能兼治水稻紋枯病和稻縱卷葉螟；
枯草芽孢桿菌TF26可抑制葵花菌核病菌、番茄和黃瓜枯萎病菌、黃瓜菌核病菌、立枯病菌水稻惡苗病菌和大豆根腐病菌等13種植物病原真菌的生長，由于微生物發酵易大規模生產，解決了實際生產中對原料提取的依賴性，降低了防治成本，因此，枯草芽孢桿菌在植物生防領域的應用具有廣闊前景。
某些肥料如磷、鐵、錳、銅、鋅肥等，如果作根施，易被土壤固定，影響施用效果，而采用葉面噴施就不會受土壤條件的限制。又如，一些果樹和其他深根系作物某些營養元素吸收量比較少，如果采用傳統的施肥方法難以施到根系吸收部位，也不能充分發揮其肥效，而葉面噴施則可取得較好的效果。
各種微量元素是作物生長發育過程中的營養物質，但施用量很少，例如鉬肥，每畝施用量僅幾十克，如果以根施方法則不易施勻。只有采取葉面噴施，才能達到經濟有效。根據研究測算，一般作物在葉面噴施硼肥，對硼的利用率是基施的8.18倍。從經濟效益上看，葉面噴施比根施要合算。
