農家肥：
區別：
1）生物有機肥完全腐熟，蟲卵率達到95%以上；農家肥堆放簡單，蟲卵率低。
2）生物有機肥無臭；農家肥有惡臭。
3）生物有機肥施用方便，均勻；農家肥施用不方便，肥料施用不均勻。
4 與生物菌肥：
區別：
1）生物有機肥價格便宜，每噸在千元左右；生物菌劑價格昂貴，每噸幾千元。
2）生物有機肥含有功能菌和有機質，能改良土壤促進被土壤固定養分的釋放；生物菌肥只含有功能菌，通過功能菌來促進土壤固定肥料的利用。
3）生物有機肥的有機質本身就是功能菌生活的環境，施入土壤后容易存活；而生物菌肥的功能菌可能不適合有的土壤環境。

生物有機肥使用注意事項
，生物有機肥施入土層不易過深。因為生物有機肥是依靠其活性來分解有機質的，其活性在一定的溫度、濕度、透氣性、有機物質的條件下才能實現。而施入太深會影響生物肥活性。因此，生物有機肥以施在地表下10 到15厘米處為宜。
生物有機肥施用時也不宜與單一化肥混施。 單一化肥因其成分單一，且酸堿程度不同，如果大量施用，勢必影響生物有機肥的生物活性。因此，生物有機肥好單施用。
生物有機肥與農家肥(生雞糞)、磷酸二銨復合肥配比要合理 給瓜果施肥的原則施生物肥要，有機肥要腐熟，化肥要元素全(根據瓜果種類不同合理配比)。在施用時應注意，生雞糞鹽過多，磷酸二銨磷過多(18個氮、 46個磷)，復合肥氮、磷、鉀配比為15：15：15或16：16：16或17：17:17，如果選用時，一定要先計算，再配比，后施用。另外，生物有機肥穴施更重要，特別是茄果類蔬菜，重茬現象不可避免。即使補施了一些生物肥、微肥，由于受溫度、濕度、透氣性、有機質等條件的影響，再加上幼苗根弱的原因，很難快速發揮作用，如果穴施生物有機肥，一方面可快速促進活躍土壤，提高土壤透氣性，促進根系快速生長發育;另一方面可緩解因有機肥不腐熟、化肥沒分解形成養分的空缺，及時供給根系養分，給根系一個良好的生長環境，促進團根早形成。

豬糞質地較細，含有較多的有機質和氮磷鉀養分，豬糞分解較慢，適宜做基肥，但人們通常認為豬是很臟的動物，其實豬是很愛干凈的，在豬圈中，豬的吃喝拉撒睡都有固定的位置，在現代化養豬條件下，豬糞處理是一項關鍵的環保技術，否則會引起環境污染，經過滾筒反應器好氧發酵處理，可以豬糞便加成有機肥，達到、無排放、無臭味，使糞土變成黃金。現有的豬糞發酵時，只是對其進行簡單的處理，現有的豬糞發酵裝置在使用時，效果不好，降低了發酵效率，同時會產生硫化氫，影響環境和人身體健康，不方便使用者的使用，降低了豬糞發酵裝置的實用性。

堆肥發酵反應器是一種集原料收集、存貯及發酵功能為一體的好氧發酵裝置，適用于對環境要求較高的養殖場、園林廢棄物處理廠、廚余垃圾處理廠、城市污泥及垃圾處理廠、豆粕、木薯渣及米糠等好氧發酵飼料加工廠等對畜禽糞便、廚余垃圾、生活污泥等進行高溫好氧發酵。結構緊湊，占地面積小，無需建設廠房，自動化程度高，節能環保。原料發酵后的成品從下方的出料口卸出，用做農業肥料、土壤改良、園林綠化等。

有機廢棄物，包含人畜糞便、餐余垃圾、污水處理廠的副產品污泥、瓜果蔬菜市場廢棄的爛瓜果爛菜葉等等，其年產量是同期工業固體廢棄物產量的10倍，量大且集中，如不及時處理將帶來嚴重的環境污染。對有機廢棄物進行堆肥化處理(好氧發酵)可以實現廢物的資源化利用，因此獲得了廣泛的應用，人們嘗試著開發了眾多的好氧發酵反應器，試圖提高好氧發酵的效率，降低發酵設備的制造成本和運行成本。

農業有機廢棄物包括農業生產產生的各類農作物秸稈，以及畜禽養殖產生的畜禽糞便等，處理難度較大，是環境治理的難題。將農業有機廢棄物畜禽糞便、秸桿等作為可利用的資源進行好氧發酵 ，不僅可以解決農業生產廢物對環境的污染問題，同時生產出來的有機肥可以帶來收益，實現了廢棄物的無害化、減量化、資源化，符合我國對環境保護和資源可持續利用的政策方針。