有機肥的生產工藝主要是將含水量低于60%的有機固體廢棄物與輔料（植物秸稈等）、微生物發酵菌劑等混合勻勻，通過池式好氧連續發酵使其充分腐熟、滅菌、除臭、去水。腐熟后的物料水分含量一般在30－35%范圍內，經篩選和磁選后可直接用于造粒生產圓球型有機肥，或經過進一步干燥生產粉狀有機。
造粒工藝流程
復合肥的工藝流程可分為：原料配料、原料攪拌、原料造粒、顆粒烘干、顆粒冷卻、顆粒分級、成品包膜、后成品包裝。
1、原料配料：
尿素、、、硫銨、磷銨（磷酸一銨、磷酸二銨、重鈣、普鈣）、（硫酸鉀）等原料按一定比例配備（根據市場需求和各地土壤檢測結果）。
2、原料攪拌：
將配好的原料攪拌均勻提高肥料顆粒整體的均勻肥效含量。
3、原料造粒：
將攪拌均勻的原料送入造粒機造粒（可用轉股造粒，也可選用擠壓造粒）.。
4、顆粒烘干：
將造粒機造好的顆粒送入烘干機，將顆粒內含的水分烘干，增加顆粒強度，便于保存。
5、顆粒冷卻：
烘干后的肥料顆粒溫度過高，易結塊，經過冷卻后的，便于裝袋保存，和運輸。
6、顆粒分級：
將冷卻過后的顆粒分級，不合格的顆粒經粉碎重新造粒，把合格的產品篩分出來。
7、成品薄膜：
將合格的產品進行涂衣包膜增加顆粒的亮度與圓潤度。
8、成品包裝：
將膜的顆粒也就是成品裝袋放在通風處保存。

隨著畜禽養殖業的迅猛發展, 產生了大量的糞便和污水。這些糞污中有害元素嚴重超標, 難以用傳統的還田方式處理。針對這一情況, 人們研發了以可移動式、固液分離技術為核心,集成配套混合機、翻料機、制粒機等肥料生產設備的有機肥生產線,。
畜禽糞便有機肥生產線及殺菌系統的開發研制, 將有利于促進畜禽糞便無害化處理、資源化利用、商品化經營生產產業鏈的形成, 達到產業化、市場化、規模化生產目標, 有效推動全市生態農業、循環經濟的發展。

由于很多種植園區常年施用化學肥料、化學農藥，普遍存在土壤板結、酸化、鹽漬化等問題，面對這樣的根系逆境環境，新栽樹苗容易出現緩苗慢、根系放不開等問題，繼而出現弱苗、黃化甚至死棵的現象。本案例中李總在柑橘小苗的毛細根區施用了奧農樂微生物菌肥，一方面奧農樂中含有包括蘇云金芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌在內8種有益微生物菌，實測活菌數可達47億/克，菌群的數量多、活性強，可以改善根際土壤環境，促進根系發達，提高肥料的吸收利用率，另外所含的固氮菌、固碳菌具有從空氣中固氮、固碳的能力，可以為作物補充氮源、碳源；第二，奧農樂中所含的20味中草藥及海藻經微生物發酵后，轉變為多糖類、生物堿類、類、腐殖酸類、海藻素等高能量物質及功能性物質，可以通過提高作物葉片中葉綠素的含量達到營養復壯、提質增產的效果，通過提高作物體內的酶活性達到、抗逆性的作用；