生物有機無機肥運用后可改進農產質量量，前進農產品安全性，增強作物本身抗逆性，削減農藥的運用，是開展現代生態農業的有用方法，大力開展推行運用，能有用處理秸稈、畜禽糞便等農業面源污染物對環境形成污染。“很多運用有機肥料，可添加土壤中有機質和腐殖酸的含量。有機肥料就是好的土壤修正劑。”

有機肥工業存在出產規模小、出產不安穩等問題，我國農業大學資源與環境學院教授李季說，現在有機肥工業技能落后、產質量量低質、商場需求缺乏，尚處于初級開展階段，但遠景非常寬廣。而關于有機肥未來的遠景問題，李季表明：“無論是果園、茶園仍是蔬菜大棚，推行有機肥代替化肥都具有共性。 　　而具體來說，蔬菜出產關于肥料和營養的需求更大，由于蔬菜出產灌溉頻率高，對營養濃度和植物吸收功率的要求更高。尋求和益，化肥的運用不可或缺。所以有機無機混合上肥的形式或許更為理想。經過噴滴灌施用水溶肥合作溝施、穴施有機肥，能夠有用改進土壤條件，前進肥料的歸納利用率。”

生物有機肥使用注意事項
，生物有機肥施入土層不易過深。因為生物有機肥是依靠其活性來分解有機質的，其活性在一定的溫度、濕度、透氣性、有機物質的條件下才能實現。而施入太深會影響生物肥活性。因此，生物有機肥以施在地表下10 到15厘米處為宜。
生物有機肥施用時也不宜與單一化肥混施。 單一化肥因其成分單一，且酸堿程度不同，如果大量施用，勢必影響生物有機肥的生物活性。因此，生物有機肥好單施用。
生物有機肥與農家肥(生雞糞)、磷酸二銨復合肥配比要合理 給瓜果施肥的原則施生物肥要，有機肥要腐熟，化肥要元素全(根據瓜果種類不同合理配比)。在施用時應注意，生雞糞鹽過多，磷酸二銨磷過多(18個氮、 46個磷)，復合肥氮、磷、鉀配比為15：15：15或16：16：16或17：17:17，如果選用時，一定要先計算，再配比，后施用。另外，生物有機肥穴施更重要，特別是茄果類蔬菜，重茬現象不可避免。即使補施了一些生物肥、微肥，由于受溫度、濕度、透氣性、有機質等條件的影響，再加上幼苗根弱的原因，很難快速發揮作用，如果穴施生物有機肥，一方面可快速促進活躍土壤，提高土壤透氣性，促進根系快速生長發育;另一方面可緩解因有機肥不腐熟、化肥沒分解形成養分的空缺，及時供給根系養分，給根系一個良好的生長環境，促進團根早形成。

生物有機肥是指特定功用微生物與主要以動植物殘體(如畜禽糞便、農作物秸稈等)為來歷并經無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。和化肥比較，生物有機肥營養元素完全，具有改善土壤、進步產品品質、改善作物根際微生物群、進步植物的抗病蟲才能、進步化肥使用率等特色，深受農喜歡。可是，在近年來生物有機肥出產經銷和實踐使用中，卻呈現了一系列亟待解決的問題，詳細如下：

農業有機廢棄物包括農業生產產生的各類農作物秸稈，以及畜禽養殖產生的畜禽糞便等，處理難度較大，是環境治理的難題。將農業有機廢棄物畜禽糞便、秸桿等作為可利用的資源進行好氧發酵 ，不僅可以解決農業生產廢物對環境的污染問題，同時生產出來的有機肥可以帶來收益，實現了廢棄物的無害化、減量化、資源化，符合我國對環境保護和資源可持續利用的政策方針。

目前，化肥被大量施用以保持農林業高產。但是，隨著化肥用量不斷增加，土壤開始板結，化肥淋入地下水也將造成水污染。近年來，我國提倡有機農業，大量應用有機肥，達到保持作物產量的同時，保護土地和環境。畜禽糞便是有機肥重要來源，2016年我國僅養殖肉牛產生的牛糞就達到15萬噸以上，為我國有機肥生產提供了充足的原料。另外，我國小麥歷年種植面積為我耕種地總面積的22％～30％，產生大量小麥秸稈，秸稈為養殖業提供飼料，也為有機肥生產提供了豐富原料。但是，豐富的原料只是生產的基礎，重要的是對這些原料的加工利用。其中關鍵的是有機肥原料的發酵腐熟技術不斷發展與創新。