生物有機肥是指特定功用微生物與主要以動植物殘體(如畜禽糞便、農作物秸稈等)為來歷并經無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。和化肥比較，生物有機肥營養元素完全，具有改善土壤、進步產品品質、改善作物根際微生物群、進步植物的抗病蟲才能、進步化肥使用率等特色，深受喜歡。

農業有機廢棄物包括農業生產產生的各類農作物秸稈，以及畜禽養殖產生的畜禽糞便等，處理難度較大，是環境治理的難題。將農業有機廢棄物畜禽糞便、秸桿等作為可利用的資源進行好氧發酵 ，不僅可以解決農業生產廢物對環境的污染問題，同時生產出來的有機肥可以帶來收益，實現了廢棄物的無害化、減量化、資源化，符合我國對環境保護和資源可持續利用的政策方針。

目前，國內現有的一些畜禽糞便發酵技術普遍存在著發酵，遠距離運輸，集中處理高成本的問題。同時因為發酵工藝落后，占地面積大，發酵過程中因發酵工藝落后造成地下水的污染和因發酵不全產生的氣味，使蚊蠅滋生對周圍環境產生嚴重影響。同時發酵生產受氣候影響嚴重，雨雪天無常工作，冬季因低溫導致設備無法處理糞便的現象。發酵時間普遍長達1-2個月，耗費工作人員數量多。

菌肥是一種以菌類為基礎的肥料，主要由菌絲體、孢子體和菌體等組成。菌肥可分為兩大類：一類是以菌絲體為主要成分，如木霉菌肥、腐霉菌肥等；另一類是以菌體和孢子體為主要成分，如果霉菌肥、曲霉菌肥等。 菌肥具有以下特點：
1. 富含有機質：菌肥主要由菌類生物轉化而來，富含有機質，能夠提供植物所需的營養元素。
2. 促進土壤活性：菌肥中的菌類有利于土壤微生物的繁殖和活動，促進土壤的生物學活性。
3. 改善土壤結構：菌肥能夠分解有機物質，改善土壤結構，增加土壤通氣性和保水能力。
4. 提高植物力：菌肥中的菌類具有一定的抗病能力，能夠提高植物的力，減少病害發生。

菌肥的使用方法：
1. 施用量：一般情況下，每畝土地使用菌肥的量為10-15公斤。
2. 施用時間：菌肥可與基肥一同施用，也可作為追肥使用。一般在種植前2-3周施用，或者在植物生長期間按需追肥。
3. 施用方式：菌肥可直接撒在土壤表面，然后輕輕耕入土中，也可與底肥或追肥混合使用。
需要注意的是，菌肥的保存要避免陽光直射和高溫環境，盡量保存在陰涼干燥處。此外，在施用菌肥時，應避免與農藥等化學物質混用，以免發生不良反應。

生物菌肥是一種由生物菌種（如細菌、真菌等）經過發酵或培養后制得的肥料。它通常包含大量的活性微生物，這些微生物能夠分解有機物質，提供植物所需的營養元素，并促進植物生長。 生物菌肥具有以下特點：
1. 提供多種養分：生物菌肥中含有豐富的有機質和微量元素，這些養分對植物生長發育至關重要。
2. 促進土壤生物活性：生物菌肥中的活性微生物能夠分解有機物質，釋放出更多的養分，并促進土壤中其他微生物的繁殖和活動，改善土壤質地和結構。
3. 增強植物力：生物菌肥中的益生菌能夠與植物形成共生關系，提高植物的抗病能力，減少病蟲害的發生。
4. 環境友好：生物菌肥不含化學合成的肥料成分，對環境污染較小，使用后不會對土壤和水體造成負面影響。