3 與農家肥：
區別：
1）生物有機肥完全腐熟，蟲卵率達到95%以上；農家肥堆放簡單，蟲卵率低。
2）生物有機肥無臭；農家肥有惡臭。
3）生物有機肥施用方便，均勻；農家肥施用不方便，肥料施用不均勻。
4 與生物菌肥：
區別：
1）生物有機肥價格便宜，每噸在千元左右；生物菌劑價格昂貴，每噸幾千元。
2）生物有機肥含有功能菌和有機質，能改良土壤促進被土壤固定養分的釋放；生物菌肥只含有功能菌，通過功能菌來促進土壤固定肥料的利用。
3）生物有機肥的有機質本身就是功能菌生活的環境，施入土壤后容易存活；而生物菌肥的功能菌可能不適合有的土壤環境。

如何有機肥好壞
一看：看有機肥料外觀顏色，物理方法干燥的有機肥料，仍保持原糞便的顏色，只是水分減少，通過堆肥技術處理的有機肥料腐熟后顏色變為褐色或黑褐色，在成品中沒有其它雜質。
二摸：用手抓一把有機肥料，其手感一致，濕時柔軟有彈性，干時很脆，容易破碎，劣質有機肥料用手可以摸到雜質，特別是沙子。
三水泡：拿兩杯清水，分別放入一些和低劣有機肥料，幾分鐘就可分辨出真偽。有機肥料摻假一般是加入沙子或土來增加重量。有機肥料在水中分布均勻，而劣質有機肥料的杯底沉入很多沙子或土，區別明顯。 [6]
生物有機肥巧鑒別
一看包裝，是否規范。包括產品登記證、產品技術指標、產品有效期；
二看物料，是否均勻。產品含水量太高或太低均不利于菌種存活，判斷方法：抓一把肥料在陽光下觀察，陰潮呈團、干燥呈灰都非正常產品。
三看效果，是否。試驗方法：加少量水將生物有機肥調成團狀，放在冰箱里凍成冰塊，第二天拿出來融化，反復三次，肥料中的菌種將會凍死或大幅度減少；這是用它和將原產品進行比較試驗、在相同的田塊里觀察差異，差異明顯是好肥料，差異不明顯，表明該產品有問題，建議放棄使用。

堆肥：各類桔稈、落葉、青草、動植物殘體、人畜糞便為原料，按比例相互混合或與少量泥土混合進行好氧發酵腐熟而成的一種肥料。
漚肥：漚肥所用原料與堆肥基本相同，只是在淹水條件下進行發酵而成.
廄肥：指豬、牛、馬、羊、雞、鴨等畜禽的糞尿與秸稈墊料堆漚制成的肥料.
沼氣肥：在密封的沼氣池中，有機物腐解產生沼氣后的副產物，包括沼氣液和殘渣。
綠肥：利用栽培或的綠色植物體作肥料。如豆科的綠豆、蠶豆、草木樨、田菁、苜蓿、苕子等。非豆科綠肥有黑麥草、肥田蘿卜、小葵子、滿江紅、水葫蘆、水花生等。
作物秸稈：農作物秸稈是重要的肥料品種之一，作物秸稈含有作物所必需的營養元素有N、P、K、 Ca、s等。
在適宜條件下通過土壤微生物的作用，這些元素經過礦化再回到土壤中，為作物吸收利用。
礦物質肥，包括鉀礦粉、磷礦粉、氯化鈣、天然硫酸鉀鎂肥等沒有經過化學加工的天然物質。此類產品要通過有機認證，并嚴格按照有機標準生產才可用于有機農業。
餅肥：菜籽餅、棉籽餅、豆餅、芝麻餅、蓖麻餅、茶籽餅等。
泥肥：未經污染的河泥、塘泥、溝泥、港泥、湖泥等。