生物菌肥的使用方法：

1、在播種前，將生物菌肥混入土壤中，與土壤混合均勻，或者將生物菌肥混入水中，攪拌均勻后灑在土壤上。

2、根據作物的種類以及品種，選擇合適的生物菌肥，并按照說明書相應的比例添加到土壤中。

3、在作物播種后，在每次施肥前，將生物菌肥混入水中，攪拌均勻后灑在土壤上。

4、在作物結果前，在每次施肥前，將生物菌肥混入水中，攪拌均勻后灑在土壤上。

5、在作物收獲后，將生物菌肥混入水中，攪拌均勻后灑在土壤上，促進作物土壤的肥力增強。

豬糞質地較細，含有較多的有機質和氮磷鉀養分，豬糞分解較慢，適宜做基肥，但人們通常認為豬是很臟的動物，其實豬是很愛干凈的，在豬圈中，豬的吃喝拉撒睡都有固定的位置，在現代化養豬條件下，豬糞處理是一項關鍵的環保技術，否則會引起環境污染，經過滾筒反應器好氧發酵處理，可以豬糞便加成有機肥，達到、無排放、無臭味，使糞土變成黃金

目前，國內現有的一些畜禽糞便發酵技術普遍存在著發酵，遠距離運輸，集中處理高成本的問題。同時因為發酵工藝落后，占地面積大，發酵過程中因發酵工藝落后造成地下水的污染和因發酵不全產生的氣味，使蚊蠅滋生對周圍環境產生嚴重影響。同時發酵生產受氣候影響嚴重，雨雪天無常工作，冬季因低溫導致設備無法處理糞便的現象。發酵時間普遍長達1-2個月，耗費工作人員數量多。

原始自然堆漚發酵，此種方法缺點比較多：
1. 發酵持續時間長，大約要在300天以上，延遲了羊糞的使用吋間，而且大量占用土地， 造成土地資源浪費；
2. 堆漚的過程中造成污染，
其氣污染.堆漚過程中，發酵期間會出現惡臭味， 一方面影響大氣質量，對周邊大 氣造成污染，另一方面影響周邊居民生活環境，危害身體健康。
其二水體污染.羊糞堆漚發酵過程中產生的各種有害病菌易隨地表水流入地下水源，造成地表水和地下水雙層污染，對工農業生產都會造成危害。
其三環境污染.堆漚過程中，促使蚊蠅滋生，傳播疾病，對人類生活特別不利。

干牛糞含有粗蛋白、粗脂肪、無氮浸出物以及粗纖維等，具有很高的養分。隨著我國對三農政策的不斷推進，肥料工業在我國得到迅速的發展和廣泛的應用，有機肥料也在高速發展。通過對牛糞進行發酵等一系列處理后能夠有效得到營養豐富的有機肥料，一方面相應國家政策，另一方面也存在的市場前景。

現在辦理還不太標準，產品標準也有待強化。國家盡管實行了登記證辦理制度，但辦理力度不行，不少未登記的企業或產品乃至冒充劣產品還在聲勢浩大地宣揚、出產和出售。別的，對國外產品亟待標準，有的國外產品價格太高，虛張聲勢，嚴峻損害了農人利益。