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由于蚯蚓糞中含有高達45%以上有機物和無機營養物以及植物生長激素，與其他肥料相比，具有衛生、無異味、顆粒細小均勻，吸水保水、透氣等性能還富含有益微生物，這些都是其他合成肥料所不具備的，因此可作為園林花卉、溫室大棚種植的有機肥。 它所含的吲哚乙酸、赤霉素等激素能促進植物生長；所含黃腐酸對植物（如花椒、番茄）生長量、葉面積等亦有明顯促進作用。
蚯蚓是低等動物，可作為高蛋白飼料添加劑。在養殖蚯蚓過程中，蚯蚓可將垃圾、秸稈等有機物質消化，混合土壤排泄出蚯蚓糞。蚯蚓糞是良好的腐熟有機肥料，同時也是具有團粒結構的土壤，對作物生長發育有較好的促進作用。農田中養殖一定數量的蚯蚓，可以起到更好的改土培肥作用。
蚯蚓糞含有豐富有機營養物質和礦物質。據有關測定結果，其有機物中除纖維外，還有糖、蛋白質、脂肪、腐殖酸、維生素和18種氨基酸。此外，硝態氮、銨態氮、磷、鉀等含量相當高，鐵、錳、銅、鋅、硼等植物必需的微量元素也頗為，還含有多種植物生長調節劑，如吲哚乙酸、赤霉素、細胞分裂素等。
隨著人們對蚯蚓糞應用中不斷發現，蚯蚓糞不僅是蚯蚓的代謝廢棄物，其在促進作物生長、提高產量、抑制植物病害和改善土壤肥力等方面均有重要作用。
