目前，國內現有的一些畜禽糞便發酵技術普遍存在著發酵，遠距離運輸，集中處理高成本的問題。同時因為發酵工藝落后，占地面積大，發酵過程中因發酵工藝落后造成地下水的污染和因發酵不全產生的氣味，使蚊蠅滋生對周圍環境產生嚴重影響。同時發酵生產受氣候影響嚴重，雨雪天無常工作，冬季因低溫導致設備無法處理糞便的現象。發酵時間普遍長達1-2個月，耗費工作人員數量多。

菌肥是一種以菌類為基礎的肥料，主要由菌絲體、孢子體和菌體等組成。菌肥可分為兩大類：一類是以菌絲體為主要成分，如木霉菌肥、腐霉菌肥等；另一類是以菌體和孢子體為主要成分，如果霉菌肥、曲霉菌肥等。 菌肥具有以下特點：
1. 富含有機質：菌肥主要由菌類生物轉化而來，富含有機質，能夠提供植物所需的營養元素。
2. 促進土壤活性：菌肥中的菌類有利于土壤微生物的繁殖和活動，促進土壤的生物學活性。
3. 改善土壤結構：菌肥能夠分解有機物質，改善土壤結構，增加土壤通氣性和保水能力。
4. 提高植物力：菌肥中的菌類具有一定的抗病能力，能夠提高植物的力，減少病害發生。

菌肥的使用方法：
1. 施用量：一般情況下，每畝土地使用菌肥的量為10-15公斤。
2. 施用時間：菌肥可與基肥一同施用，也可作為追肥使用。一般在種植前2-3周施用，或者在植物生長期間按需追肥。
3. 施用方式：菌肥可直接撒在土壤表面，然后輕輕耕入土中，也可與底肥或追肥混合使用。
需要注意的是，菌肥的保存要避免陽光直射和高溫環境，盡量保存在陰涼干燥處。此外，在施用菌肥時，應避免與農藥等化學物質混用，以免發生不良反應。

微生物菌肥集生物菌、中草藥、礦物質三效合一，從二十余味中草藥及海藻中發酵出的多糖類、生物堿類、類、腐殖酸類、海藻素等生物活性成分，為作物補充高能量物質及功能性物質，能夠開啟并促進植物次生代謝。

微生物菌的用量，目的是為了防治根結線蟲及其它病害，微生物用量加大了，可大大減少其它藥劑的用量，還可以改良土壤，為作物提供好的微生態環境，促進生根，增強作物長勢，提質增產。中草藥制劑青枯立克具有結合的，含有的小檗堿、皂苷素類物質可以直接殺死病原菌，含有的多糖、多肽等高能量物質可以為其補充營養物質，增強作物抗逆性，防病治病的同時，營養復壯作物，標本兼治。

本品含有的微量元素能有效調節葉面氣孔開閉及水分蒸騰，增強作物抗旱、抗干熱風、抗寒及抗低溫的能力，對旱作農業具有重要意義。
生物菌能固氮并活化土壤中沉積的磷和鉀，提高肥料利用率，調控養分釋放，并且在其他元素供應過量時，有抑制供給的特點。
生物菌在植物根系周圍形成保護屏障，抑制、和生理害的發生。