農(nóng)家肥：
區(qū)別：
1）生物有機肥完全腐熟，蟲卵率達到95%以上；農(nóng)家肥堆放簡單，蟲卵率低。
2）生物有機肥無臭；農(nóng)家肥有惡臭。
3）生物有機肥施用方便，均勻；農(nóng)家肥施用不方便，肥料施用不均勻。
4 與生物菌肥：
區(qū)別：
1）生物有機肥價格便宜，每噸在千元左右；生物菌劑價格昂貴，每噸幾千元。
2）生物有機肥含有功能菌和有機質(zhì)，能改良土壤促進被土壤固定養(yǎng)分的釋放；生物菌肥只含有功能菌，通過功能菌來促進土壤固定肥料的利用。
3）生物有機肥的有機質(zhì)本身就是功能菌生活的環(huán)境，施入土壤后容易存活；而生物菌肥的功能菌可能不適合有的土壤環(huán)境。

生物有機肥使用注意事項
，生物有機肥施入土層不易過深。因為生物有機肥是依靠其活性來分解有機質(zhì)的，其活性在一定的溫度、濕度、透氣性、有機物質(zhì)的條件下才能實現(xiàn)。而施入太深會影響生物肥活性。因此，生物有機肥以施在地表下10 到15厘米處為宜。
生物有機肥施用時也不宜與單一化肥混施。 單一化肥因其成分單一，且酸堿程度不同，如果大量施用，勢必影響生物有機肥的生物活性。因此，生物有機肥好單施用。
生物有機肥與農(nóng)家肥(生雞糞)、磷酸二銨復合肥配比要合理 給瓜果施肥的原則施生物肥要，有機肥要腐熟，化肥要元素全(根據(jù)瓜果種類不同合理配比)。在施用時應注意，生雞糞鹽過多，磷酸二銨磷過多(18個氮、 46個磷)，復合肥氮、磷、鉀配比為15：15：15或16：16：16或17：17:17，如果選用時，一定要先計算，再配比，后施用。另外，生物有機肥穴施更重要，特別是茄果類蔬菜，重茬現(xiàn)象不可避免。即使補施了一些生物肥、微肥，由于受溫度、濕度、透氣性、有機質(zhì)等條件的影響，再加上幼苗根弱的原因，很難快速發(fā)揮作用，如果穴施生物有機肥，一方面可快速促進活躍土壤，提高土壤透氣性，促進根系快速生長發(fā)育;另一方面可緩解因有機肥不腐熟、化肥沒分解形成養(yǎng)分的空缺，及時供給根系養(yǎng)分，給根系一個良好的生長環(huán)境，促進團根早形成。

有機廢棄物，包含人畜糞便、餐余垃圾、污水處理廠的副產(chǎn)品污泥、瓜果蔬菜市場廢棄的爛瓜果爛菜葉等等，其年產(chǎn)量是同期工業(yè)固體廢棄物產(chǎn)量的10倍，量大且集中，如不及時處理將帶來嚴重的環(huán)境污染。對有機廢棄物進行堆肥化處理(好氧發(fā)酵)可以實現(xiàn)廢物的資源化利用，因此獲得了廣泛的應用，人們嘗試著開發(fā)了眾多的好氧發(fā)酵反應器，試圖提高好氧發(fā)酵的效率，降低發(fā)酵設備的制造成本和運行成本。