3 與農家肥：
區別：
1）生物有機肥完全腐熟，蟲卵率達到95%以上；農家肥堆放簡單，蟲卵率低。
2）生物有機肥無臭；農家肥有惡臭。
3）生物有機肥施用方便，均勻；農家肥施用不方便，肥料施用不均勻。
4 與生物菌肥：
區別：
1）生物有機肥價格便宜，每噸在千元左右；生物菌劑價格昂貴，每噸幾千元。
2）生物有機肥含有功能菌和有機質，能改良土壤促進被土壤固定養分的釋放；生物菌肥只含有功能菌，通過功能菌來促進土壤固定肥料的利用。
3）生物有機肥的有機質本身就是功能菌生活的環境，施入土壤后容易存活；而生物菌肥的功能菌可能不適合有的土壤環境。

生物有機肥使用注意事項
，生物有機肥施入土層不易過深。因為生物有機肥是依靠其活性來分解有機質的，其活性在一定的溫度、濕度、透氣性、有機物質的條件下才能實現。而施入太深會影響生物肥活性。因此，生物有機肥以施在地表下10 到15厘米處為宜。
生物有機肥施用時也不宜與單一化肥混施。 單一化肥因其成分單一，且酸堿程度不同，如果大量施用，勢必影響生物有機肥的生物活性。因此，生物有機肥好單施用。
生物有機肥與農家肥(生雞糞)、磷酸二銨復合肥配比要合理 給瓜果施肥的原則施生物肥要，有機肥要腐熟，化肥要元素全(根據瓜果種類不同合理配比)。在施用時應注意，生雞糞鹽過多，磷酸二銨磷過多(18個氮、 46個磷)，復合肥氮、磷、鉀配比為15：15：15或16：16：16或17：17:17，如果選用時，一定要先計算，再配比，后施用。另外，生物有機肥穴施更重要，特別是茄果類蔬菜，重茬現象不可避免。即使補施了一些生物肥、微肥，由于受溫度、濕度、透氣性、有機質等條件的影響，再加上幼苗根弱的原因，很難快速發揮作用，如果穴施生物有機肥，一方面可快速促進活躍土壤，提高土壤透氣性，促進根系快速生長發育;另一方面可緩解因有機肥不腐熟、化肥沒分解形成養分的空缺，及時供給根系養分，給根系一個良好的生長環境，促進團根早形成。

堆肥：各類桔稈、落葉、青草、動植物殘體、人畜糞便為原料，按比例相互混合或與少量泥土混合進行好氧發酵腐熟而成的一種肥料。
漚肥：漚肥所用原料與堆肥基本相同，只是在淹水條件下進行發酵而成.
廄肥：指豬、牛、馬、羊、雞、鴨等畜禽的糞尿與秸稈墊料堆漚制成的肥料.
沼氣肥：在密封的沼氣池中，有機物腐解產生沼氣后的副產物，包括沼氣液和殘渣。
綠肥：利用栽培或的綠色植物體作肥料。如豆科的綠豆、蠶豆、草木樨、田菁、苜蓿、苕子等。非豆科綠肥有黑麥草、肥田蘿卜、小葵子、滿江紅、水葫蘆、水花生等。
作物秸稈：農作物秸稈是重要的肥料品種之一，作物秸稈含有作物所必需的營養元素有N、P、K、 Ca、s等。
在適宜條件下通過土壤微生物的作用，這些元素經過礦化再回到土壤中，為作物吸收利用。
礦物質肥，包括鉀礦粉、磷礦粉、氯化鈣、天然硫酸鉀鎂肥等沒有經過化學加工的天然物質。此類產品要通過有機認證，并嚴格按照有機標準生產才可用于有機農業。
餅肥：菜籽餅、棉籽餅、豆餅、芝麻餅、蓖麻餅、茶籽餅等。
泥肥：未經污染的河泥、塘泥、溝泥、港泥、湖泥等。