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水產養殖復合芽孢桿菌枯草芽孢桿菌、納豆芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌、臘狀芽孢桿菌以孢子狀態進入消化道后，迅速由休眠狀態，在短期內繁殖成高含菌量的優勢種群，消耗掉腸道內大量氧氣，并能產生過氧化氫、素，建立微生態平衡，促進有益厭氧微生物的繁殖，抑制有害（大腸桿菌、沙門氏桿菌）的生長，從而預防腹瀉、下痢等道疾病。
水產養殖復合芽孢桿菌在快速繁殖過程中，產生大量多種維生素、有機酸、、蛋白酶（特別是堿性蛋白酶）、糖化酶、脂肪酶、，能降解植物性飼料中復雜的有機物，從而促進消化吸收，提高飼料利用率，防止動物消化不良，出現“飼料便”等狀況發生。
雞糞有機肥含有大量有益微生物。有益微生物在土壤中繁殖，可以增加土壤有機氮的含量，促進磷鉀在土壤中的活性和有效性，發揮其固氮、磷、鉀的作用，提高肥料利用率。有益微生物的大量繁殖可以遏制土壤中有害細菌的生長和傳播，提高作物的抗病能力，有效抵抗病蟲害，抗病能力強，抗寒能力強，抗凍能力強。
