蚯蚓是低等動物，可作為高蛋白飼料添加劑。在養殖蚯蚓過程中，蚯蚓可將垃圾、秸稈等有機物質消化，混合土壤排泄出蚯蚓糞。蚯蚓糞是良好的腐熟有機肥料，同時也是具有團粒結構的土壤，對作物生長發育有較好的促進作用。農田中養殖一定數量的蚯蚓，可以起到更好的改土培肥作用。

蚯蚓糞是一種黑色、均一、有自然泥土味的細碎類物質，具有很好的孔性、通氣性、排水性和高的持水量。微小的顆粒狀還能幫助增進土壤與空氣盡可能地接觸，因為它們同土壤混合后使土壤不再板結和堅硬。蚯蚓糞因有很大的表面積，使得許多有益微生物得以生存，并具有吸收和保持營養物質的能力。

由于蚯蚓糞中含有高達45%以上有機物和無機營養物以及植物生長激素，與其他肥料相比，具有衛生、無異味、顆粒細小均勻，吸水保水、透氣等性能還富含有益微生物，這些都是其他合成肥料所不具備的，因此可作為園林花卉、溫室大棚種植的有機肥。
它所含的吲哚乙酸、赤霉素等激素能促進植物生長；所含黃腐酸對植物（如花椒、番茄）生長量、葉面積等亦有明顯促進作用。

能改善被污染土壤和改善土壤肥力隨著工業的發展，重金屬對土壤和農作物的污染越來越嚴重。土壤中的重金屬除部分被植物吸收外，絕大部分都會長期積存在土壤中而難以消除。當有毒重金屬如鉛、鎘、砷等被農作物吸收后，便會被畜禽和人類攝入體內，給健康帶來不利影響。蚯蚓糞顆粒小，具有多孔性，比表面積龐大，吸附能力強，可以較大程度地吸附土壤中的重金屬； 蚯蚓糞中的腐殖酸也是一種很強的吸附劑，能吸附可溶態重金屬而降低其生物有效性；蚯蚓糞中的大量微生物群本身就能與土壤中各種有機和無機膠體相互作用而對重金屬進行吸附、富集、沉淀等，從而降低重金屬的可利用性。由此可見，蚯蚓糞在修復土壤、鈍化土壤中有害重金屬方面也起到重要作用。 　 　
在改善土壤物理結構和肥力方面蚯蚓糞亦有重大貢獻。蚯蚓糞本身具有的團粒結構，施入土中后，在大量微生物不斷作用下，土壤可釋放出有效養分，同時增加腐殖質含量。腐殖質與鈣離子結合并與土粒凝聚成結構穩定的團粒結構，從而改善土壤的物理性狀。

蚯蚓糞的有機質含量可達25%-38%，腐殖質含量21%-40%，氮含量0.95-2.5%，磷含量1.1-2.9%，鉀含量0.96-2.2%，另外還含有大量的粗蛋白，粗纖維和鈣、鐵、錳、鋅、銅等微量元素。

蚯蚓糞中還富含各種微生物，微生物不僅可以使復雜的物質礦化為易于植物吸收的有效營養成分，還能合成一系列有生物活性的物質，如糖、氨基酸、維生素等，這是蚯蚓糞所特有的性質。正是因為蚯蚓糞含有大量的營養物質，和微生物菌群，對植物生長有著神奇的效果，才被譽為“有機肥”。