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蚓糞中富含細菌、放線菌和真菌，這些微生物不僅使復雜物質礦化為植物易于吸收的有效物質，而且還合成一系列有生物活性的物質，如糖、氨基酸、維生素等，這些物質的產生使蚓糞具有許多特殊性質。
通過有益微生物和蚯蚓的生命活動，產生了生長素、細胞分裂素、赤霉素、吲哚酸等植物激素，促進植物生長，調控植物代謝；還會產生大量多糖。其中的有益微生物還能產生拮抗活性強、抗菌譜廣的抗生素，限制病原菌的生長，使植物土傳病害得到抑制。
蚯蚓是低等動物，可作為高蛋白飼料添加劑。在養殖蚯蚓過程中，蚯蚓可將垃圾、秸稈等有機物質消化，混合土壤排泄出蚯蚓糞。蚯蚓糞是良好的腐熟有機肥料，同時也是具有團粒結構的土壤，對作物生長發育有較好的促進作用。農田中養殖一定數量的蚯蚓，可以起到更好的改土培肥作用。
蚯蚓糞是黑褐色、均勻、有自然泥土氣味的細小顆粒，是一種生物有機肥。 蚯蚓糞特點是將有機物、微生物和有益菌合理地結合，能改善土壤現有環境，達到增肥、促生長、抗病、增產目的。
在改善土壤物理結構和肥力方面蚯蚓糞亦有重大貢獻。蚯蚓糞本身具有的團粒結構，施入土中后，在大量微生物不斷作用下，土壤可釋放出有效養分，同時增加腐殖質含量。腐殖質與鈣離子結合并與土粒凝聚成結構穩定的團粒結構，從而改善土壤的物理性狀。
