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雖然有機肥的成分種類較多，但是每種養分的含量相對較少，并且病菌較多。需要存放腐熟以殺滅病菌、并與化學肥料配合使用，效果更好。
隨著科學技術的不斷發展，通過有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養技術，將有益菌群接入無害化處理后有機肥中，可以生產出多種多樣不同品種的生物有機肥，它能改善土質、減少環境污染、增肥增效等。
有機農業中使用的有機肥需經過有機認證機構的認證，符合產品的生產標準。近些年來，我國各種生物肥料發展迅速，年產量達數十萬噸以上。這些生物肥料以科技含量較高、增產效果明顯和為主要特點，它的生產、推廣和應用對增進土壤肥力，提高農作物產量，改善農作物品質和切實推行農業可持續發展都有積極意義。 針對生物肥料在生產、產品質量和使用等方面存在的問題，本刊記者采訪了江西農業大學高勇生教授，旨在提高農村廣大群眾對這類肥料的認識，更加正確、科學地使用這些肥料，以促進我國生物肥料的健康發展。

機肥、生物有機肥、復合微生物肥料、微生物菌劑”四大系列，發酵雞糞，完全腐熟雞糞，干雞糞塊為原料的產品下轄100多種產品，針對種植戶作物的微生物肥料。根據不同地區土壤和作物的情況，結合各地種植習慣和土壤、作物面臨的問題，針對性的添加不同的微生物菌群，研發出適合各種土壤、作物的肥料。公司產品完全采用畜禽糞便，通過工業化的系統操作流程加工生產的有機肥，完全符合"一號文件"提出的實施"沃土工程"和"農業生態保護"的要求，產品銷往全國各地，廣泛應用于蔬菜、果樹、大田、綠化、水產等領域，為中國農業種植產業提供了的肥料。讓獼猴桃、核桃、香蕉、橙子、栗子、茶葉、花卉、蔬菜、果樹等作物不再“金貴”，“對癥”的服務就在您的身邊

看有機肥料外觀顏色，物理方法干燥的有機肥料，仍保持原糞便的顏色，只是水分減少，通過堆肥技術處理的有機肥料腐熟后顏色變為褐色或黑褐色，在成品中沒有其它雜質。 二摸：用手抓一把有機肥料，其手感一致，濕時柔軟有彈性，干時很脆，容易破碎，劣質有機肥料用手可以摸到雜質，特別是沙子。 三水泡：拿兩杯清水，分別放入一些和低劣有機肥料，幾分鐘就可分辨出真偽。有機肥料摻假一般是加入沙子或土來增加重量。有機肥料在水中分布均勻，而劣質有機肥料的杯底沉入很多沙子或土，區別明顯。

在對微生物肥料的知道方面，近幾年形成了較大誤區，農人沒有真實知道生物有機肥，也就不能合理使用生物有機肥，然后降低了微生物肥料的名譽。

有機肥真假鑒別
1.泡水法
　　取一水杯，把有機肥樣品泡在水里，然后用手把泡在水里的有機肥碾碎，攪一下能直觀的看出有機肥的原料；再放置一段時間，如果有機肥與水短時間內分層的話說明有機肥比重大，含土較多。
　　2.聞味法
　　仔細聞一下肥的味道看是否有氨味，糞便味，淤泥味，好的有機肥應該是一種腐熟的味道。
　　3.手捻法
　　取有機肥用大拇指和食指來回碾壓，如果有硌手的感覺，則里面有沙粒或其他雜質。
　　4.菌種測試法
　　取一水杯把有機肥放在里面，撒少許水（注意不要泡水，潮濕就行），放在溫暖適宜的地方，好的有機肥會抱團長出白色菌絲，掰開有機肥顆粒會看到里面也有白色菌絲。
　　5.盆栽測試法
　　取一盆花，抓把有機肥直接撒在花的根莖部，澆上水，好的有機肥會逐漸長出白色菌絲，促進植株生長，質量不合格的有機肥會熏苗，植株逐漸萎靡，直至。
　　6.對比試驗法
　　選擇好有機肥后在種植作物時，留出一部分不施用該有機肥，觀察植株的表現，好的有機肥在長勢、產量、品質上都會有明顯的效果。 [5]

主要來源于植物和（或）動物，施于土壤以提供植物營養為其主要功能的含碳物料。經生物物質、動植物廢棄物、植物殘體加工而來，消除了其中的有毒有害物質，富含大量有益物質，包括：多種有機酸、肽類以及包括氮、磷、鉀在內的豐富的營養元素。不僅能為農作物提供全面營養，而且肥效長，可增加和更新土壤有機質，促進微生物繁殖，改善土壤的理化性質和生物活性，是綠色食品生產的主要養分廣義
俗稱農家肥，包括以各種動物、植物殘體或代謝物組成，如人畜糞便、秸稈、動物殘體、屠宰場廢棄物等。
另外還包括餅肥（菜籽餅、棉籽餅、豆餅、芝麻餅、蓖麻餅、茶籽餅等）；堆肥；漚肥；廄肥；沼肥；綠肥等。
主要是以供應有機物質為手段，借此來改善土壤理化性能，促進植物生長及土壤生態系統的循環。