農業有機廢棄物包括農業生產產生的各類農作物秸稈，以及畜禽養殖產生的畜禽糞便等，處理難度較大，是環境治理的難題。將農業有機廢棄物畜禽糞便、秸桿等作為可利用的資源進行好氧發酵 ，不僅可以解決農業生產廢物對環境的污染問題，同時生產出來的有機肥可以帶來收益，實現了廢棄物的無害化、減量化、資源化，符合我國對環境保護和資源可持續利用的政策方針。

我國是農業資源大國，每年產生的秸桿7億多噸，秸桿資源大部分被作為農戶生活燃料或在田間焚燒或被棄置亂堆，不僅造成了秸桿資源的嚴重浪費，而且還導致了環境的污染。隨著秸桿的綜合利用技術越來越成熟，越來越多的秸桿將被綜合利用，其中利用秸桿發酵制造肥料是秸桿利用的一個重要方面，但是目前秸桿發酵都是在自然狀態下進行的，發酵時間較長，不能滿足大量處理秸桿的要求。

目前，化肥被大量施用以保持農林業高產。但是，隨著化肥用量不斷增加，土壤開始板結，化肥淋入地下水也將造成水污染。近年來，我國提倡有機農業，大量應用有機肥，達到保持作物產量的同時，保護土地和環境。畜禽糞便是有機肥重要來源，2016年我國僅養殖肉牛產生的牛糞就達到15萬噸以上，為我國有機肥生產提供了充足的原料。另外，我國小麥歷年種植面積為我耕種地總面積的22％～30％，產生大量小麥秸稈，秸稈為養殖業提供飼料，也為有機肥生產提供了豐富原料。但是，豐富的原料只是生產的基礎，重要的是對這些原料的加工利用。其中關鍵的是有機肥原料的發酵腐熟技術不斷發展與創新。

原始自然堆漚發酵，此種方法缺點比較多：
1. 發酵持續時間長，大約要在300天以上，延遲了羊糞的使用吋間，而且大量占用土地， 造成土地資源浪費；
2. 堆漚的過程中造成污染，
其氣污染.堆漚過程中，發酵期間會出現惡臭味， 一方面影響大氣質量，對周邊大 氣造成污染，另一方面影響周邊居民生活環境，危害身體健康。
其二水體污染.羊糞堆漚發酵過程中產生的各種有害病菌易隨地表水流入地下水源，造成地表水和地下水雙層污染，對工農業生產都會造成危害。
其三環境污染.堆漚過程中，促使蚊蠅滋生，傳播疾病，對人類生活特別不利。

干牛糞含有粗蛋白、粗脂肪、無氮浸出物以及粗纖維等，具有很高的養分。隨著我國對三農政策的不斷推進，肥料工業在我國得到迅速的發展和廣泛的應用，有機肥料也在高速發展。通過對牛糞進行發酵等一系列處理后能夠有效得到營養豐富的有機肥料，一方面相應國家政策，另一方面也存在的市場前景。

牛養殖場每年會產生幾萬噸的牛糞，牛糞對環境污染嚴重，如長期堆積不僅產生令人不適的臭味，而且因其含有大腸菌、線蟲等病菌和害蟲等有害物質，不能及時處理就會容易滋生病菌與蟲害造成環境污染，影響人體健康。牛糞為牛的代謝產物，干牛糞中含有粗蛋白10％-20％，粗脂肪1％-3％，無氮浸出物20％-30％，粗纖維15％-30％，營養物質豐富；所以牛糞可以用于飼料加工、有機肥制作、沼氣發酵等方面。但牛糞作為飼料加工原料，目前使用率低，難以規模化消化牛糞；若進行沼氣發酵，制沼氣后沼氣池底部牛糞沉淀物，清理具有風險性，而且清理出的沉淀物也會造成第二次污染。