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另外，應該積極引進自然科學方法，來判斷玉的材料、產地及琢玉工藝。自從引進掃描電子顯微鏡照相，中紅外光譜測定，近紅外光譜測定等物理學方法，玉材的顯微結構和礦物組成問題得到了解決。從新疆和田，青海昆侖山，遼寧岫巖，河南南陽，臺東花蓮等產玉區礦物組成的測定，為出土古代玉器材料產地的確定提供了可靠地對比資料，再有模擬實驗和微痕研究，則解決了長期以來有關線切割和鉈切割、手刻及鉈刻的爭論。

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清代玉器的真偽鑒定難度，要比高古玉的識別難度大的多。原因是有很多清代玉器沒有入過土，因此玉器的整體效果上沒有入土必有的各種特征。有些既便入土，但不超過三五的地下埋藏，對玉器的侵蝕并不嚴重，特征也不十分明顯。

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另一個識別難度是現代制玉，仍然可以用清代民國時期的設備工具，和加工方法磨制玉器。由于技術和手段相近，因而偽造清代玉器相對比較容易，同時也難于鑒別。雖然鑒別難度很大，但是無論用現代的設備工具，還是延用明清時期的設備工具造假，從器物的工藝處理特征上，真與偽新與老仍然能夠識別出來。簡單的說，出于賺錢進行造假，用這種企圖心和目的偽造贗品，必然帶著急工盡力的偽造心態，這種心態一定會造成磨制中的加工缺陷。例如：線條磨寬了、窄了、深了、淺了、磨削過頭了，或者沒有磨制到位。有些工藝死角磨制處理的粗糙，過度強化拋光造成的拋光劃痕，光亮度過高以及亮度不均勻等。有些贗品加工完成以后，再進行機械或者化學腐蝕方面的做舊處理，用這種強化處理偽裝清代玉器的老舊狀態。贗品與清代玉器的材料差別；風格造型；比例結構方面的差別；以及繪畫功力，與加工技術體現的工藝和美術的結合方面，通過清代玉器與現代贗品的對比，能夠找到很多證據。

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要認識各種玉器材料的基本結構特征，并且要知道硬度、密度的不均勻性及玉石材料的可滲透性。當掌握了玉石材料的基本特性以后就能夠分析古玉在特定環境和條件下，埋藏的時間長短，對玉器本身應該造成的影響，有哪些氧化腐蝕特征，并掌握其演化過程的各種特征規律。而贗品不是根據材料的特性，也不根據真品的各種特征，只是根據真品的表面效果進行模仿，違反了自然氧化和演變的規律，與真品有本質上的差別。

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色質是玉的自然屬性。一塊古玉，無論是“傳世古”還是“出土古”，經過歲月的撫摸和水土的侵蝕，必然會留下種種色質的印記，從而為鑒別古玉提供了可靠的依據。這里所謂的“色質”，色即沁色，質指玉質，而沁色通常會成為一塊古玉的重要鑒定標準。

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玉的舊色中受鑒玉者重視的是玉器在土中埋藏時受到的土中所含其他元素的影響，會產生顏色變化，古文獻中稱其為沁色，其中較為常見的有鐵銹色、銅綠色、暗黃色、黑色、白色。
人們常稱其為鐵銹沁、銅沁、土沁、水銀沁、水沁。
這些色變中除了白色可使玉質硬度產生很大的變化而不太受歡迎外，其他帶有色變的玉器，往往市場價格不帶色變的玉器。
盤玉是手或肌膚與玉器摩擦，一些有沁色的玉器因人體的摩擦會產生顏色變化，這類顏色變化被人們稱為“盤色”。一般來講，舊玉久盤會產生熟舊感。