全自動殺菌鍋有很多種，在我國傳統的高溫殺菌一般采用水浴式殺菌和蒸氣殺菌即我們常說的水殺和汽殺兩種殺菌方式，上個世紀九十年代開始為了滿足軟包裝等特殊的產品生產要求，開始從日本引進雙層殺菌鍋即日式殺菌鍋，新世紀伊始，西班牙、德國、法國等歐洲國家為了節約能源和水資源，推出一種帶熱交換器的水淋式殺菌鍋，特別是法國采用的鍋內蒸氣循環系統，以達到高溫節能、短時、節約水資源等目的。

臥式殺菌鍋是利用壓縮空氣作反壓力的圓筒體殺菌設備，其鍋蓋鎖緊型式是采用自鎖楔塊嚙合方法，開閉起動方便，適應于罐頭、飲料對馬口鐵罐和玻璃罐罐頭的殺菌處理工作。臥式殺菌鍋是利用壓縮空氣作反壓力的圓筒體殺菌設備，其鍋蓋鎖緊型式是采用自鎖楔塊嚙合方法，開閉起動方便，適應于罐頭、飲料對馬口鐵罐和玻璃罐罐頭的殺菌處理工作。臥式殺菌鍋結構： 鍋體----包括鍋身、鍋蓋、轉環、軌道、密封圈、滾輪、鎖緊楔塊、蒸汽、噴管、冷卻水管及閘閥等。

電汽兩用殺菌鍋汽源可由電或蒸汽來供給，殺菌前可預先設定到所需要溫度和壓力，通過電接點壓力表進行自動控壓，通過溫控儀控制殺菌溫度，低于一定溫度時可自動加溫，從而確保了在殺菌時溫度的準確性。用蒸汽時可通過鍋爐蒸汽直接進行升溫殺菌。

有些系統在殺菌和冷卻過程中使用過壓，以保持容器的完整性和平衡抵消罐內的壓力。這樣做是必要的，因為有些包裝容器對內部壓力的忍受力有限。過壓殺菌容器的某些實例還有帶熱封蓋的或雙金屬接縫罐端的半剛性塑料容器、軟包袋袋、金屬盤、紙板容器和玻璃罐。在250℉時的壓力大約是15（磅/平方英寸），任何施加于殺菌鍋的超過該15的壓力都稱之為過壓。

不同殺菌形式的全自動殺菌鍋也適應于對不同種類產品的殺菌。其中全水浴式殺菌適合于罐頭和玻璃瓶；蒸汽殺菌更適合于馬口鐵；水淋式和水汽混合殺菌幾乎可以應用到各種產品，水淋式更適合于軟包裝和PV盒裝，水汽混合殺菌更是可以適合于特種產品的殺菌；而且帶熱交換器的水淋式和水汽混合殺菌可以節約很多水資源和熱能量，尤其是水汽混合殺菌。

水浴式殺菌鍋是通過直接注入蒸汽，使熱水罐的水升溫到預定溫度，然后注入工藝罐，同時使鍋內的工藝用水不斷循環，并通過水汽混合器循環加熱滅菌。從而縮短了殺菌時間，提高工作效率。殺菌的工藝水可循環使用，節省了能源、時間及人力、物力的消耗，降低了生產成本。水浴式殺菌鍋可分為：雙層水浴式殺菌鍋、雙鍋并聯水浴式殺菌鍋、三鍋并聯水浴式殺菌鍋。