全自動殺菌鍋有很多種，在我國傳統的高溫殺菌一般采用水浴式殺菌和蒸氣殺菌即我們常說的水殺和汽殺兩種殺菌方式，上個世紀九十年代開始為了滿足軟包裝等特殊的產品生產要求，開始從日本引進雙層殺菌鍋即日式殺菌鍋，新世紀伊始，西班牙、德國、法國等歐洲國家為了節約能源和水資源，推出一種帶熱交換器的水淋式殺菌鍋，特別是法國采用的鍋內蒸氣循環系統，以達到高溫節能、短時、節約水資源等目的。

臥式殺菌鍋是利用壓縮空氣作反壓力的圓筒體殺菌設備，其鍋蓋鎖緊型式是采用自鎖楔塊嚙合方法，開閉起動方便，適應于罐頭、飲料對馬口鐵罐和玻璃罐罐頭的殺菌處理工作。臥式殺菌鍋是利用壓縮空氣作反壓力的圓筒體殺菌設備，其鍋蓋鎖緊型式是采用自鎖楔塊嚙合方法，開閉起動方便，適應于罐頭、飲料對馬口鐵罐和玻璃罐罐頭的殺菌處理工作。臥式殺菌鍋結構： 鍋體----包括鍋身、鍋蓋、轉環、軌道、密封圈、滾輪、鎖緊楔塊、蒸汽、噴管、冷卻水管及閘閥等。

為更均勻好溫度分布熱量傳遞和F值，熱水噴淋系統在處理罐內每一個托盤的二邊，各均設三個扇形噴嘴，噴嘴將熱水均勻呈扇形噴出，使每層托盤中的物料均勻受熱，同時使罐內溫度在殺菌過程的所有階段始終保持非常穩定，了F值的變化及蒸煮過度等現象減小至低限度。由于鍋內只有少量循環水，并采用率換熱器，所以，食品升溫速度快，一般情況下，在蒸汽壓力為0.5時，鍋內水溫從20度升到121度，只需10~15分鐘，這樣可以大限度的保留食品的風味和色澤，也能降低能源的消耗。

水浴式殺菌鍋是通過直接注入蒸汽，使熱水罐的水升溫到預定溫度，然后注入工藝罐，同時使鍋內的工藝用水不斷循環，并通過水汽混合器循環加熱滅菌。從而縮短了殺菌時間，提高工作效率。殺菌的工藝水可循環使用，節省了能源、時間及人力、物力的消耗，降低了生產成本。

不同殺菌形式的全自動殺菌鍋也適應于對不同種類產品的殺菌。其中全水浴式殺菌適合于罐頭和玻璃瓶；蒸汽殺菌更適合于馬口鐵；水淋式和水汽混合殺菌幾乎可以應用到各種產品，水淋式更適合于軟包裝和PV盒裝，水汽混合殺菌更是可以適合于特種產品的殺菌；而且帶熱交換器的水淋式和水汽混合殺菌可以節約很多水資源和熱能量，尤其是水汽混合殺菌。

電汽兩用殺菌鍋汽源可由電或蒸汽來供給，殺菌前可預先設定到所需要溫度和壓力，通過電接點壓力表進行自動控壓，通過溫控儀控制殺菌溫度，低于一定溫度時可自動加溫，從而確保了在殺菌時溫度的準確性。用蒸汽時可通過鍋爐蒸汽直接進行升溫殺菌。電汽兩用殺菌鍋適用于各種軟、硬罐頭食品高溫滅菌，延長保質期的設備。電汽兩用殺菌鍋從形式上分單層和雙層：單層加熱管在鍋底部；雙層加熱管在上部蒸汽發生器內。從殺菌方式分蒸汽殺菌鍋和淋水殺菌，同時淋水殺菌又分頂噴殺菌和側噴殺菌。